ศักยภาพของ Phenylethanoid Glycosides จาก Herba Cistanches กับ Oecuar Lyeeanisn

มะเร็งเซลล์ตับ: ขึ้นอยู่กับเภสัชวิทยาเครือข่ายและการเชื่อมต่อระดับโมเลกุลZHANG Jiawei ', WEN Limei? , HU Junping', YANG Jianhua? (1 College of Pharmaceutical Sciences , Xinjang Medical University, Urumqi 830054, China; 2 Department of Pharmacy, First Affiliated Hospital of Xinjiang Medical University, Urumqi 830011, China)

เชิงนามธรรม

วัตถุประสงค์: เพื่อสำรวจศักยภาพกลไกระดับโมเลกุลของฟีนิลทานอยด์ไกลโคไซด์จากแฮร์ฮา ซิสแทนเชส(CPhGs)ต่อต้านมะเร็งเซลล์ตับ (HCC) ผ่านทางเภสัชวิทยาเครือข่ายและการเชื่อมต่อระดับโมเลกุล วิธีการ: ดึงข้อมูลส่วนผสมออกฤทธิ์และเป้าหมายที่เป็นไปได้ของ CPhG จาก "ฐานข้อมูลและแพลตฟอร์มการวิเคราะห์ทางเภสัชวิทยาของระบบการแพทย์แผนจีน ('TCMSP) และฐานข้อมูลและวรรณกรรมอื่นๆ และเป้าหมายที่เกี่ยวข้องกับ HCC จาก "ฐานข้อมูลเป้าหมายการรักษา ('TT), Genecardsand ฐานข้อมูลอื่นๆ ด้วยเหตุนี้ เป้าหมายทั่วไปของ CPhG และโรคจึงได้รับผล และมีการสร้างเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนและโปรตีน (PPl) เพื่อคัดกรองเป้าหมายหลัก เป้าหมายหลักถูกนำเข้าสู่ DAVlD สำหรับการเสริมสมรรถนะยีน Ontology (GO) และการเพิ่มคุณค่าวิถีสารานุกรมเกียวโตของยีนและจีโนม (KEGG) สุดท้ายนี้ AutoDock vina ถูกนำมาใช้เพื่อเชื่อมต่อโมเลกุลของส่วนผสมออกฤทธิ์หลักและเป้าหมายหลัก ผลลัพธ์: คัดแยกสารออกฤทธิ์ทั้งหมด 29 ชนิดใน CPhGs ที่เกี่ยวข้องกับยีนเป้าหมาย 410 ตัว เส้นทางการส่งสัญญาณที่เกี่ยวข้องโดยตรงกับการรักษา HCC คือเส้นทางการส่งสัญญาณของมะเร็ง,มะเร็งโปรตีโอไกลแคน วิถีทาง, วิถีการส่งสัญญาณฟอสฟาทิดิลโนซิทอล 3-ไคเนส-โปรตีนไคเนส B ( Pl3K-Akt ), วิถีการส่งสัญญาณปัจจัยการเจริญเติบโตของหลอดเลือดบุผนังหลอดเลือด (VEGF) ฯลฯ 'ผลการเชื่อมต่อระดับโมเลกุลแสดงให้เห็นว่าโปรตีนของตัวรับเป้าหมายที่ผ่านการคัดกรองมีสัมพรรคภาพการจับสูงกับ ส่วนผสมที่ใช้งานอยู่ สรุป: CPhG อาจควบคุมเซลล์มะเร็ง การสร้างเส้นเลือดใหม่ และอื่นๆ ผ่านองค์ประกอบหลายส่วน หลายเป้าหมาย และหลายวิถีทาง ดังนั้นจึงออกผลการรักษาต่อ HCC

คำหลัก - มะเร็งเซลล์ตับ; เภสัชวิทยาเครือข่าย โมเลกุล doc.kingถังน้ำ

สารสกัด CISTANCHE สำหรับการปกป้องตับ

มะเร็งตับระยะแรกr เป็นหนึ่งในเนื้องอกเนื้อร้ายที่มีการเจ็บป่วยและเสียชีวิตสูงในโลก และอัตราการรอดชีวิตภายใน 5 ปีมีเพียง 7% เท่านั้น [1] มะเร็งเซลล์ตับ (HCC) เป็นมะเร็งชนิดที่สำคัญที่สุด ซึ่งคิดเป็นมากกว่า 85% [2] ข้อมูลล่าสุดแสดงให้เห็นว่าอัตราการเสียชีวิตและอุบัติการณ์ของ HCC ในประเทศของฉันอยู่ในอันดับที่สามและสี่ตามลำดับในบรรดาเนื้องอกเนื้อร้ายทั้งหมด และมีลักษณะของการพัฒนาที่รวดเร็วและการกลับเป็นซ้ำได้ง่าย [3-4]- สาเหตุและพยาธิกำเนิดของมะเร็งตับยังไม่ชัดเจน การเกิดขึ้นอาจเกี่ยวข้องกับความหลากหลายของยีนโฮสต์ ปัจจัยด้านสิ่งแวดล้อม (รวมถึงกลุ่มอาการเมตาบอลิซึมและอะฟลาทอกซิน B1) การดื่มแอลกอฮอล์ และปัจจัยของไวรัส (รวมถึงไวรัสตับอักเสบบีและการติดเชื้อไวรัสตับอักเสบซี) ) ที่เกี่ยวข้องกับปฏิสัมพันธ์ [5] ยาแผนจีนสามารถใช้กับผู้ป่วยที่มี HCC ขั้นสูงและมีฤทธิ์ในการต่อต้านเนื้องอก ลดอาการไม่พึงประสงค์จากการรักษาด้วยรังสีและเคมีบำบัด ปรับปรุงภูมิคุ้มกันของผู้ป่วยเนื้องอก และปรับปรุงคุณภาพชีวิต [6] Cistanche Deserticola เป็นพืชในวงศ์ Orobanchiaceae Cistanche cistanche Cistanche DeserticolaY C. Ma หรือ Cistanche tuberosum Cistanche Cistanche เช ตูบูโลซา (เชงก์)

ลำต้นเนื้อแห้งมีใบเป็นสะเก็ดของไวท์ [7] มีหน้าที่บำรุงไต, เติมเต็มเอสเซ้นส์และความชุ่มชื้น

มีฤทธิ์ทำให้แห้งและเป็นยาระบาย เป็นยาชูกำลังที่หายากและมีคุณค่า ซึ่งมีลักษณะเฉพาะในพื้นที่แห้งแล้งทางตะวันตกเฉียงเหนือของประเทศของฉัน และมีประวัติการใช้มายาวนาน Cistanche Deserticola ได้รับการบันทึกครั้งแรกใน "Materia Medica ของ Shen Nong" ของราชวงศ์ฮั่นตะวันออก: "มีรสหวานและอุ่นเล็กน้อย ใช้รักษาอาการเจ็บครรภ์ทั้ง 5 ประเภทและอาการบาดเจ็บ 7 รายการ ช่วยบำรุงบริเวณตรงกลาง ขจัดความเย็น ความร้อน และความเจ็บปวดในลำต้น บำรุงอวัยวะภายในทั้งห้าเสริมสร้างหยินเติมสาระสำคัญและฉีและช่วยในการคลอดบุตรและอาการของผู้หญิง "การใช้ระยะยาวจะทำให้ร่างกายเบาขึ้น" และจัดเป็นเกรดสูงสุด [8] Cistanche Deserticola Total phenylethanoid glycosides ( ฟีนี⁃

Lethanoid Glycosides จาก Cistanche, CPhGs) เป็น Cistanches ส่วนผสมหลักที่ใช้งานอยู่ในนั้น ได้แก่ verbascoside, echinaceaside, salidroside, 2′-acetyl verbascoside, tubulin B เป็นต้น [9]มีหน้าที่ในการป้องกันตับ ป้องกันภาวะสมองเสื่อม ป้องกันความเหนื่อยล้า ป้องกันภาวะขาดเลือด ป้องกันโรคกระดูกพรุน ยาระบาย ควบคุมระบบภูมิคุ้มกัน ต่อต้านวัย และปรับปรุงระบบสืบพันธุ์ [10]

การศึกษาได้พิสูจน์แล้วว่า CPhG มีผลดีในการป้องกันและรักษามะเร็งตับ การวิจัยโดยหยวนและคณะ [11] แสดงให้เห็นว่า CPhGs ยับยั้งการเจริญเติบโตของเซลล์ H22 ผ่านวิถีการตายของเซลล์จากภายนอกและภายนอก หูเชียง และคณะ [12] พบว่า CPhG สามารถยับยั้งการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็งตับ ซึ่งอาจเกี่ยวข้องกับ CPhGs ที่ลดปริมาณ AFP ในซีรั่มของหนูที่มีเนื้องอก และปรับปรุงภูมิคุ้มกันของหนูที่มีเนื้องอก ปัจจุบัน ยังไม่มีการศึกษาเชิงลึกเกี่ยวกับบทบาทของ CPhG ในการป้องกันและรักษา HCC และกลไกการออกฤทธิ์ระดับโมเลกุลของมัน และส่วนประกอบออกฤทธิ์ เป้าหมายการออกฤทธิ์ และกลไกระดับโมเลกุลยังไม่ได้รับการอธิบายอย่างครบถ้วน

เภสัชวิทยาเครือข่ายปรับปรุงแนวทาง "หนึ่งเป้าหมาย หนึ่งยา" ที่มีอยู่ให้เป็นแนวทางการวิจัย "เป้าหมายเครือข่าย-หลายองค์ประกอบ" ซึ่งบนพื้นฐานนี้ จะดำเนินการวิเคราะห์อย่างครอบคลุมเกี่ยวกับประสิทธิภาพของการแพทย์แผนจีน และสำรวจการแพทย์แผนจีน จากมุมมองที่เป็นระบบและในระดับโมเลกุล สร้างแนวคิดใหม่สำหรับเครือข่ายเภสัชวิทยาของการแพทย์แผนจีน [13-14] การศึกษานี้ใช้กลยุทธ์เภสัชวิทยาแบบเครือข่ายและอิงตามมุมมองแบบองค์รวมของการแพทย์แผนจีน เพื่อสำรวจกลไกการออกฤทธิ์ของ CPhG ในการป้องกันและรักษา HCC อย่างเป็นระบบ เมื่อรวมกับโมเดลเครือข่ายหลายระดับของ "TCM⁃ส่วนผสมออกฤทธิ์⁃เป้าหมาย⁃เส้นทางการส่งสัญญาณ" ประสิทธิภาพของ CPhG ในการป้องกันและรักษา HCC จะได้รับการคาดการณ์ เป้าหมายหลักและกลไกการออกฤทธิ์ได้รับการตรวจสอบโดยใช้เทคโนโลยีการเชื่อมต่อระดับโมเลกุล และมีรายละเอียดกลไกการทำงานร่วมกันขององค์ประกอบหลายองค์ประกอบ หลายเป้าหมาย และหลายเส้นทางของ CPhGs ซึ่งปรับปรุงขอบเขตการพัฒนาทรัพยากรยาของ CPhGs อย่างมีนัยสำคัญ และช่วยให้ อ้างอิงสำหรับการวิจัยครั้งต่อไป

1 วัสดุและวิธีการ

1.1 การรวบรวมส่วนประกอบ CPhG

โดยการค้นหาฐานข้อมูลเภสัชวิทยาระบบการแพทย์แผนจีนและแพลตฟอร์มการวิเคราะห์ (ฐานข้อมูลเภสัชวิทยาระบบการแพทย์แผนจีนและแพลตฟอร์มการวิเคราะห์, TCM SP), สารานุกรมฐานข้อมูลการแพทย์แผนจีน (สารานุกรมการแพทย์แผนจีน) พระเจ้า, ETCM), ฐานข้อมูลที่ครอบคลุมการแพทย์แผนจีน (การแพทย์แผนจีน ทอร์นาโด

ฐาน TCCMID) และฐานข้อมูลอื่นๆ และรวมกับข้อมูลโครงสร้างพื้นฐานองค์ความรู้ระดับชาติ

ฐานข้อมูล (โครงสร้างพื้นฐานความรู้แห่งชาติของจีน เอกสารที่เกี่ยวข้องกับ C ในฐานข้อมูล NKI และ PubMed ถูกนำมาใช้เพื่อรวบรวมองค์ประกอบทางเคมีและข้อมูลเป้าหมายของ CPhGs ด้วยการค้นหาในฐานข้อมูล TCMSP, ETCM, TCMID และวรรณกรรม ทำให้สามารถระบุสารประกอบ 29 ชนิดได้ในที่สุด

เป็นสารประกอบตัวเลือก [15-16]

1.2 การทำนายเป้าหมายการรักษาที่เป็นไปได้ของยาและการสร้างแผนภาพเครือข่าย "TCM-ส่วนผสมที่ออกฤทธิ์-เป้าหมาย"

ไฟล์รูปแบบ SDF ของส่วนประกอบที่ดึงมาจะถูกนำเข้าไปยังฐานข้อมูล PharmMapper เพื่อทำการวิเคราะห์เชิงคาดการณ์ของเป้าหมายที่เป็นไปได้ และใช้ฟังก์ชันการค้นหา UniProt KB เพื่อแก้ไขชื่อเป้าหมาย ซอฟต์แวร์ Cytoscape 3. 8. 0 ถูกใช้เพื่อสร้างแผนภาพเครือข่าย "TCM-Active Ingredient-Target"

1.3 การคัดกรองยีนที่เกี่ยวข้องกับ HCC

ใช้ "มะเร็งเซลล์ตับ" และ "HCC" เป็นคำหลักเพื่อค้นหาในฐานข้อมูล 4 ฐานข้อมูลต่อไปนี้เพื่อรับข้อมูลเป้าหมาย HCC: 1) O ฐานข้อมูล MIM; 2) ฐานข้อมูลดรักแบงก์; 3) ฐานข้อมูล GeneCards; 4) ฐานข้อมูลเป้าหมายการรักษา (ฐานข้อมูลเป้าหมายการรักษา, TTD, http://db.i drlab.net/ttd) หลังจากการคัดกรองข้อมูลเป้าหมายจะถูกสรุปและจัดระเบียบ

1. 4 การทำแผนที่เป้าหมายของ CPhG สำหรับการรักษา HCC

ในการสร้าง Waynetu ผ่านซอฟต์แวร์วาดภาพออนไลน์ เป้าหมายของส่วนประกอบ CPHGS จะถูกแมปกับเป้าหมาย HCC เป้าหมายทางแยกคือเป้าหมายที่เป็นไปได้ของหมวดหมู่ HCC ของส่วนประกอบ CPHGS เป้าหมายแยกโรค

1. 5. การสร้างปฏิสัมพันธ์ของโปรตีน ５

(PROTEIN⁃PROTEIN Intere⁃ACTION, PPI) the network uses the STRING database: / / / / sTRING⁃DB. ORG /) for PPI analysis of the target. Set the COMBI NED SCORE>{{0}}. 4 และใช้ Cytoscape 3.8.0 เพื่อทำการวิเคราะห์ทอพอโลยีกับผลลัพธ์ และคัดกรองเป้าหมายหลักที่ใช้ร่วมกันที่มีค่าระดับมากกว่า 2 เท่าของค่ามัธยฐาน

1.6 การวิเคราะห์การเพิ่มคุณค่าของยีน Ontology (GO) และสารานุกรมเกียวโตของยีนและจีโนม (สารานุกรมเกียวโต) ของยีนและจีโนม, KEGG) การวิเคราะห์การเพิ่มคุณค่า

ฐานข้อมูล DAVID ถูกใช้เพื่อทำการวิเคราะห์ GO และการวิเคราะห์การเพิ่มคุณค่าวิถี KEGG บนโปรตีนเป้าหมายที่ CPhGs และ HCC โต้ตอบด้วย และเกณฑ์ P น้อยกว่าหรือเท่ากับ {{0}}.05 ถูกตั้งค่าเป็นหน้าจอ ออกจากกระบวนการทางชีวภาพและวิถีทางที่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ และใช้ Cy⁃to ｓｃAlｐּ 3. 8.0 ซอฟต์แวร์สร้างเครือข่าย "TCM⁃Active Ingredients⁃Targets⁃Pathway"

1.7 การตรวจสอบการเชื่อมต่อระดับโมเลกุลของเป้าหมายหลัก เลือกโปรตีนเป้าหมายหลัก

สีขาวถูกใช้สำหรับการเชื่อมต่อโมเลกุล ไฟล์โครงสร้างผลึกของโปรตีนเป้าหมายเหล่านี้ได้มาจากฐานข้อมูล RCSBPDB ไฟล์โครงสร้างของส่วนผสมออกฤทธิ์ของเป้าหมายเหล่านี้ได้มาจากฐานข้อมูล PubChem ซอฟต์แวร์ Autododock_vina ถูกนำมาใช้ในการคำนวณความสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนเป้าหมายกับพลังงานการจับยึดที่ต่ำที่สุดระหว่างส่วนผสมออกฤทธิ์ และจะแสดงภาพผลลัพธ์ของการตรวจสอบการจำลองการเชื่อมต่อของโมเลกุล