การแสดงออกของยีนภูมิคุ้มกันและเครือข่ายการทำงานในคลาสโรคไตอักเสบลูปัสที่แตกต่างกัน Ⅱ
Nov 08, 2023
ผลลัพธ์
การกำหนดลักษณะเฉพาะของกลุ่ม
จากการเก็บถาวรของเราการตรวจชิ้นเนื้อไต FFPEเราระบุชิ้นเนื้อ LN 55 ชิ้นที่มีเนื้อเยื่อเพียงพอสำหรับการวิเคราะห์ การตัดชิ้นเนื้อมาจากผู้ป่วยเพศหญิงและประกอบด้วยการตัดชิ้นเนื้อคลาส III (n=11), คลาส IV (n=23) และการตัดชิ้นเนื้อคลาส V (n=21) LN รวมเฉพาะการตัดชิ้นเนื้อ Class III และ IV LN ที่มีรอยโรค (เช่น A หรือ A/C แต่ไม่ใช่ C) เราใช้โรค TBM (n=14) เป็นกลุ่มควบคุม นอกจากนี้เรายังเปรียบเทียบคลาส V LN กับ MN (n =9) โดยให้ความคล้ายคลึงทางเนื้อเยื่อวิทยาที่ชัดเจนบนกล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสง แต่มีสาเหตุที่แตกต่างกัน ข้อมูลประชากร คลินิก และการตรวจชิ้นเนื้อแสดงไว้ในตารางที่ 1 อายุของการตรวจชิ้นเนื้ออยู่ระหว่างอายุต่ำกว่า 1 ปีถึงมากกว่า 11 ปี รอยโรคของไตที่ใช้งานอยู่ เสี้ยวของไต และเนื้อร้ายมีอยู่ในคลาส III และ IV แต่ไม่มีการตัดชิ้นเนื้อคลาส V LN ภาวะลิ่มเลือดอุดตันในไตถูกระบุในการตรวจชิ้นเนื้อประเภทที่ 3 เท่านั้น การรวม Tubuparticular (TRIs) ถูกระบุในการตรวจชิ้นเนื้อคลาส III (91%), คลาส IV (78%) และคลาส V (81%) ส่วนใหญ่ IFTA อยู่ในระดับต่ำในทุกชั้นเรียนเซรั่มครีเอตินีนและโปรตีนในปัสสาวะ:ครีเอตินีนอัตราส่วนสูงกว่าในคลาส IV เมื่อเทียบกับคลาส III หรือคลาส V LN (ตารางที่ 1 รูปเสริมออนไลน์ 1A และ B) เซรั่มอัลบูมินลดลงในทุกคลาสที่สัมพันธ์กับ TBM (ตารางที่ 1, รูปที่ 1B เสริมออนไลน์) ส่วนเสริม C3 และ C4 ถูกลดลงอย่างมีนัยสำคัญทั้งในคลาส III และคลาส IV เมื่อเปรียบเทียบกับคลาส V LN (ตารางที่ 1, รูปที่ 1C เสริมออนไลน์)
คลิกที่นี่เพื่อรับสูตรสมุนไพรของ CISTANCHE สำหรับไต
การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนภูมิคุ้มกันในการตรวจชิ้นเนื้อไต LN
ก่อนอื่นเราเปรียบเทียบการแสดงออกของยีนระหว่างคลาส LN ทั้งหมดและตัวอย่าง TBM และระบุ 171 (เพิ่มขึ้น 159 และลดลง 12) ยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (รูปที่ 1A, ข้อมูลเสริมออนไลน์ S3) การวิเคราะห์วิถีทางแสดงให้เห็นว่าการส่งสัญญาณ IFN ประเภท I ได้รับการเสริมสมรรถนะอย่างสูงใน LN เหนือการควบคุม นอกเหนือจากการส่งสัญญาณ JAK-STAT, การเสริมน้ำตก, MHC II, การเชื่อมโยง Integrin, NF-κB และวิถีการตายของเซลล์ (รูปที่ 1B, ข้อมูลเสริมออนไลน์ S4 และ S5) การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้นโดยใช้การถอดเสียงที่มีการเปลี่ยนแปลง log2 เท่า (FC) มากกว่าหรือเท่ากับ 1 (n=49) หรือน้อยกว่าหรือเท่ากับ −0.5 (n=5) มากกว่า กลุ่มประชากรทั้งหมดเปิดเผยกลุ่มหลักสามกลุ่ม (รูปที่ 1C) จากซ้ายไปขวาในรูปที่ 1C กลุ่มที่ 1 มีเฉพาะตัวอย่าง LN (n=16) กลุ่มที่ 2 มีตัวอย่าง TBM ทั้งหมดยกเว้นตัวอย่างเดียว (n=13TBM, n=3LN) และกลุ่ม 3 มีลักษณะเด่นของ LN (n=36LN เทียบกับ n=1TBM) ตามที่รายงานไว้ 16 ไม่มีความสัมพันธ์ที่ชัดเจนระหว่างกระจุกโมเลกุลและคลาส LN ทางเนื้อเยื่อวิทยา (รูปที่ 1C)
การเปรียบเทียบคลาส V LN และ MN ที่ไม่ทราบสาเหตุ
รอยโรคทางเนื้อเยื่อในระดับ V LN มีลักษณะเป็นเยื่อกระจายไตมีความคล้ายคลึงกับ MN ที่ไม่ทราบสาเหตุ เมื่อเราเปรียบเทียบคลาส V LN กับตัวอย่าง MN มียีนที่แสดงออกแตกต่างกัน 26 ตัว (สูงกว่า 23 ตัวและการแสดงออกต่ำกว่า 3 ตัว) (รูปที่ 2A ข้อมูลเสริมออนไลน์ S6) คำเสริมคุณค่าสูงสุดคือการส่งสัญญาณ IFN ประเภทที่ 1 (รูปที่ 2B ข้อมูลเสริมออนไลน์ S4 และ S7) ชุดแกนหลักของยีนที่เกี่ยวข้องกับ IFN 67 ประเภท I ได้รับการควบคุมทั่วทั้งชุดย่อยของเม็ดเลือดขาว (นิวโตรฟิล, เซลล์ T บวก CD4 และ CD8, โมโนไซต์) ใน SLE.24 แผงของเรามีโพรบที่กำหนดเป้าหมาย 17 ของยีนเหล่านี้และ 13 จาก 23 ทรานสคริปต์ที่สูงกว่า การแสดงออกเป็นส่วนหนึ่งของชุดหลักนี้ ซึ่งบ่งชี้ว่าลายเซ็น IFN ประเภท I เป็นความแตกต่างระดับโมเลกุลที่สำคัญระหว่างคลาส V LN และ MN
รูปที่ 1 DGE ใน LN เปรียบเทียบกับโรค TBM ( A ) พล็อตภูเขาไฟที่แสดงให้เห็น DGE ของ LN ( n =55 ชิ้นเนื้อ) เทียบกับโรค TBM (ชิ้นเนื้อ n =14 ชิ้น) Benjamini-Hochberg ปรับค่าจุดตัด p=0.05 และ log2 FC=0.5 (B) เครือข่ายปฏิสัมพันธ์ STRING สำหรับยีนที่แสดงออกแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญทั้ง 171 ยีนระหว่าง LN และ TBM (คะแนนความเชื่อมั่นสูงสุด=0.9) โหนดสีแดง - ประเภท I IFN; โหนดสีน้ำเงิน— เสริมน้ำตก; โหนดสีชมพู — MHC II; โหนดสีเหลือง - การส่งสัญญาณ JAK-STAT; โหนดสีม่วง—การรวมอินทิกริน; โหนดสีเขียวอ่อน - โดเมน NF-κB + TIR; โหนดสีเขียวเข้ม - NF-κBและการปรับการตายของเซลล์ (C) แผนที่ความร้อนของการถอดเสียงที่แสดงความแตกต่างที่เพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญทั้งหมดด้วย log2 FC มากกว่าหรือเท่ากับ 1 (n=49) และการถอดเสียงที่ลดลงอย่างมีนัยสำคัญทั้งหมดด้วย log2 FC น้อยกว่าหรือเท่ากับ −0.5 (n=5 ) ที่ระบุใน LN เทียบกับ TBM ทั่วทั้งกลุ่ม (การตัดชิ้นเนื้อ LN n=55 ชิ้น, ชิ้นเนื้อ MN =9 ชิ้น, ชิ้นเนื้อ TBM n=14 ชิ้น) DGE การแสดงออกของยีนที่แตกต่าง FC พับเปลี่ยน; LN, โรคไตอักเสบลูปัส; MN, โรคไตเยื่อ; NS ไม่มีนัยสำคัญ TBM เมมเบรนชั้นใต้ดินแบบบาง
การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้นโดยใช้การถอดเสียงที่เกี่ยวข้องกับ IFN 17 ประเภท I แยก LN ออกจากทั้งตัวอย่าง MN และ TBM (รูปที่ 2C) สัดส่วนของการตัดชิ้นเนื้อ LN ในกลุ่ม IFN-positive (n =48, 87%) นั้นมากกว่าสัดส่วนของการตัดชิ้นเนื้อ IFN เชิงลบ (n =7, 13%, p อย่างมีนัยสำคัญ<0.0001, Fisher exact test). Within the IFNpositive cluster, the next hierarchy contained two clusters, with higher or lower IFN expression. The proportion of class V LN samples in the cluster with lower IFN expression (n=14, 74%) was significantly greater than that in the cluster with higher IFN expression (n=5, 26%, p=0.0009, Fisher exact test). TRIs in glomerular endothelial cells is frequent in LN and related to the type I IFN response. TRIs were present in 45 out of 54 LN biopsies (83%, data unavailable for one biopsy) and of the 47 biopsies in the IFN-positive cluster, 89% (n=42) had TRIs (figure 2C). We measured the blood type I IFN signature in 25 (46%) of the 55 patients with LN. A high blood IFN score was present in 13 (62%) of the 21 patients within the renal biopsy IFN-positive cluster and 1 of the 5 (20%) of patients within the renal biopsy IFN-negative cluster. There were no significant differentially expressed genes between MN and TBM samples (online supplemental figure 2, online supplemental data S15).
การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนภายในคลาส LN ทางเนื้อเยื่อวิทยา
ต่อไปเราทำ DGE (รูปที่ 3A – C) และการวิเคราะห์เส้นทาง (รูปที่ 3 เพิ่มเติมออนไลน์และข้อมูลเสริมออนไลน์ S4, S16 – S18) สำหรับแต่ละคลาส LN เมื่อเปรียบเทียบกับโรค TBM ในคลาส III LN มียีนที่แสดงออกแตกต่างกัน 63 ยีน (เพิ่มขึ้น 60 ยีนและลดลง 3 ยีน รูปที่ 3A ข้อมูลเสริมออนไลน์ S8); ในคลาส IV LN 205 ยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (เพิ่มขึ้น 189 รายการและลดลง 16 รายการ รูปที่ 3B ข้อมูลเสริมออนไลน์ S9) และในคลาส V LN 95 ยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (เพิ่มขึ้น 92 รายการและลดลง 3 รายการ รูปที่ 3C ข้อมูลเสริมออนไลน์ S10) มียีนที่แสดงออกแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญ 52 ยีนที่พบได้ทั่วไปในคลาสต่างๆ (รูปที่ 3 มิติ ตารางเสริมออนไลน์ 2) และการวิเคราะห์วิถีแสดงให้เห็นการเพิ่มประสิทธิภาพสำหรับประเภท IFN สัญญาณลิง ส่วนเสริม และวิถีทาง MHC II (รูปที่ 3E ข้อมูลเสริมออนไลน์ S4 และ S11) FC นั้นมากกว่าในคลาส IV สำหรับยีนทั้งหมด 52 ตัวเมื่อเปรียบเทียบกับคลาส V และสำหรับ 85% ของยีนเมื่อเปรียบเทียบกับคลาส III (ตารางเสริมออนไลน์ 2)
เมื่อเปรียบเทียบกับโรค TBM มียีน 105 ยีนที่แสดงความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในคลาส IV แต่ไม่พบในการตรวจชิ้นเนื้อคลาส III หรือ V LN (รูปที่ 3 มิติ) การวิเคราะห์วิถีทางแสดงให้เห็นถึงการเพิ่มประสิทธิภาพสำหรับการส่งสัญญาณ NF-κB และโดเมนความต้านทาน Toll-IL1- การควบคุมเชิงบวกของกระบวนการเมตาบอลิซึมของสายพันธุ์รีแอคทีฟออกซิเดชั่น (ROS) และการควบคุมเชิงบวกของวิถีการออกฤทธิ์ของเปปทิเดส (รูปที่ 3F ข้อมูลเสริมออนไลน์ S4 และ S12 ). เมื่อเราวางแผนขนาดเอฟเฟกต์ของการถอดเสียงคลาส IV ทั้งหมด 205 รายการที่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญพร้อมขนาดเอฟเฟกต์ตามลำดับสำหรับคลาส III (รูปที่ 3G) และคลาส IV (รูปที่ 3H) LN การเปลี่ยนแปลงส่วนใหญ่สอดคล้องกัน สิ่งนี้ชี้ให้เห็นว่าการถอดเสียงจำนวนเล็กน้อยในชุดข้อมูลของเราได้รับการควบคุมที่แตกต่างกันโดยเฉพาะในการตัดชิ้นเนื้อคลาส IV LN (เช่น โดยที่ขนาดเอฟเฟกต์ที่มีนัยสำคัญในการถอดเสียงคลาส IV LN มีขนาดเอฟเฟกต์ต่ำหรือเป็นศูนย์ในคลาส III หรือคลาส IV LN)
เพื่อสำรวจความแตกต่างระหว่าง LN ที่มีการแพร่กระจายและเยื่อหุ้มเซลล์ เราเปรียบเทียบคลาส IV กับคลาส V LN สิ่งนี้แสดงให้เห็นว่า 179 (167 สูงกว่าและ 12 การแสดงออกต่ำกว่า) ยีนที่แสดงออกแตกต่างกันในคลาส IV (รูปที่ 4A, ข้อมูลเสริมออนไลน์ S13) การวิเคราะห์วิถีทางแสดงให้เห็นการเพิ่มคุณค่าสำหรับการส่งสัญญาณ IFN ประเภทที่ 1, การส่งสัญญาณ JAK-STAT, การเสริม Cascade, MHC II, การเชื่อมโยง Integrin, NF-κB และวิถีการตายของเซลล์ (รูปที่ 4B, ข้อมูลเสริมออนไลน์ S4 และ S14) ในขณะที่เส้นทางเหล่านี้ส่วนใหญ่ถูกระบุในการวิเคราะห์คลาสย่อยเดี่ยวของเราของคลาส IV และ V เมื่อเปรียบเทียบกับโรค TBM (รูปที่ 3BC เสริมออนไลน์) ตามลำดับ เราสังเกตเห็นการควบคุมและการเสริมแต่งที่สำคัญเพิ่มเติมสำหรับเส้นทางเหล่านี้ในคลาส IV เทียบกับคลาส V ( รูปที่ 4B)
รูปที่ 4 การแสดงออกของยีนที่แตกต่างระหว่างคลาส IV และคลาส V LN แผนภูเขาไฟที่แสดงการแสดงออกของยีนที่แตกต่าง (DGE) ของการตัดชิ้นเนื้อระดับ IV (n=23 ชิ้นเนื้อ) เทียบกับชิ้นชิ้นเนื้อระดับ V (n=21 ชิ้น) เบนจามินี-ฮอชเบิร์กปรับค่า p=0.05 และ log2 FC คัทออฟ=0.5 (B) เครือข่ายปฏิสัมพันธ์ STRING สำหรับยีนที่แสดงออกแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญ 167 ยีนพร้อมการแสดงออกที่สูงกว่าในคลาส IV และคลาส V (คะแนนความเชื่อมั่นสูงสุด=0.9) โหนดสีแดง - ประเภท I IFN; โหนดสีน้ำเงิน—เสริมน้ำตก; โหนดสีชมพู — MHC II; โหนดสีเหลือง - การส่งสัญญาณ JAK-STAT; โหนดสีม่วง—การรวมอินทิกริน; โหนดสีเขียวอ่อน - โดเมน NF-κB + TIR; โหนดสีเขียวเข้ม - NF-κBและการปรับการตายของเซลล์ FC พับเปลี่ยน; LN, โรคไตอักเสบลูปัส; NS ไม่มีนัยสำคัญ
เมื่อเปรียบเทียบกับโรค TBM มียีน 105 ยีนที่แสดงความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในคลาส IV แต่ไม่พบในการตรวจชิ้นเนื้อคลาส III หรือ V LN (รูปที่ 3 มิติ) การวิเคราะห์วิถีทางแสดงให้เห็นถึงการเพิ่มประสิทธิภาพสำหรับการส่งสัญญาณ NF-κB และโดเมนความต้านทาน Toll-IL1- การควบคุมเชิงบวกของกระบวนการเมตาบอลิซึมของสายพันธุ์รีแอกทีฟออกซิเดชั่น (ROS) และการควบคุมเชิงบวกของวิถีการออกฤทธิ์ของเปปทิเดส (รูปที่ 3F ข้อมูลเสริมออนไลน์ S4 และ S12) . เมื่อเราวางแผนขนาดเอฟเฟกต์ของการถอดเสียงคลาส IV ทั้งหมด 205 รายการที่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญพร้อมขนาดเอฟเฟกต์ตามลำดับสำหรับคลาส III (รูปที่ 3G) และคลาส IV (รูปที่ 3H) LN การเปลี่ยนแปลงส่วนใหญ่สอดคล้องกัน สิ่งนี้ชี้ให้เห็นว่าการถอดเสียงจำนวนเล็กน้อยในชุดข้อมูลของเราได้รับการควบคุมที่แตกต่างกันโดยเฉพาะในการตัดชิ้นเนื้อคลาส IV LN (เช่น โดยที่ขนาดเอฟเฟกต์ที่มีนัยสำคัญในการถอดเสียงคลาส IV LN มีขนาดเอฟเฟกต์ต่ำหรือเป็นศูนย์ในคลาส III หรือคลาส IV LN)
เพื่อสำรวจความแตกต่างระหว่าง LN ที่มีการแพร่กระจายและเยื่อหุ้มเซลล์ เราเปรียบเทียบคลาส IV กับคลาส V LN สิ่งนี้แสดงให้เห็นว่า 179 (167 สูงกว่าและ 12 การแสดงออกต่ำกว่า) ยีนที่แสดงออกแตกต่างกันในคลาส IV (รูปที่ 4A, ข้อมูลเสริมออนไลน์ S13) การวิเคราะห์วิถีแสดงการเพิ่มขึ้นสำหรับการส่งสัญญาณ IFN ชนิด I, การส่งสัญญาณ JAK-STAT, แคสเคดคอมพลีเมนท์, MHC II, การจับอินทิกริน, NF-κB และเส้นทางการตายของเซลล์(รูปที่ 4B ข้อมูลเสริมออนไลน์ S4 และ S14) ในขณะที่เส้นทางเหล่านี้ส่วนใหญ่ถูกระบุในการวิเคราะห์คลาสย่อยเดี่ยวของเราของคลาส IV และ V เมื่อเปรียบเทียบกับโรค TBM (รูปที่ 3BC เสริมออนไลน์) ตามลำดับ เราสังเกตเห็นการควบคุมและการเสริมแต่งที่สำคัญเพิ่มเติมสำหรับเส้นทางเหล่านี้ในคลาส IV เทียบกับคลาส V ( รูปที่ 4B)
การอภิปราย
การศึกษาของเราและอื่นๆ16 18 19 ได้แสดงให้เห็นถึงความเป็นไปได้ของการใช้เทคโนโลยี NanoString เพื่อวัดปริมาณการแสดงออกของการถอดเสียงในเนื้อเยื่อชิ้นเนื้อไต FFPEและที่น่าสังเกตก็คือ สามารถทำได้โดยใช้การตัดชิ้นเนื้อที่มีอายุไม่เกิน 11 ปี วิธีการนี้มีประโยชน์ทางคลินิกที่มีศักยภาพ เนื่องจากเนื้อเยื่อ FFPE เป็นองค์ประกอบสำคัญของเส้นทางการตรวจชิ้นเนื้อไตเพื่อการวินิจฉัย ในการเปรียบเทียบ LN กับโรค TBM ของเรา มีการระบุกลุ่มเครือข่าย STRING ที่สำคัญ 36 กลุ่ม โดยมีคำศัพท์ 10 อันดับแรกที่เกี่ยวข้องกับ NF-κB (กลุ่ม STRING 6 อันดับแรก รวม 8 จาก 36 รายการ) หรือการส่งสัญญาณ IFN alpha/beta (6 จาก 36 กลุ่ม STRING) . ส่วนเสริมก็เป็นตัวแทนอย่างมากเช่นกัน (6 จาก 36 STRING คลัสเตอร์) สอดคล้องกับข้อมูลที่เผยแพร่ เราสามารถตรวจจับลายเซ็น IFN ประเภท 1 ใน LN ทั้งสามคลาสได้ 16 ลายเซ็นการถอดเสียงที่เกี่ยวข้องกับ IFN นี้แสดงได้ดีมากใน LN จนแยกความแตกต่างอย่างชัดเจนระหว่างคลาส V LN และ MN แม้ว่าจะมีความคล้ายคลึงกันทางสัณฐานวิทยาที่โดดเด่นก็ตาม สิ่งที่น่าสนใจคือไม่มีการถอดเสียงเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญเมื่อเราเปรียบเทียบ MN กับ TBM
การศึกษาโปรไฟล์ระดับโมเลกุลของ LN ครั้งแรกโดยใช้โกลเมอรูลีที่จับด้วยเลเซอร์จากเนื้อเยื่อแช่แข็งจากผู้ป่วยที่มี LN ที่มีการเจริญ (คลาส III และ IV) 17 กลุ่มยีนสี่กลุ่มที่ระบุเซลล์ B, การตอบสนอง IFN ประเภท 1, เชื้อสายไมอีลอยด์ และการผลิตนอกเซลล์ เมทริกซ์ถูกอธิบายไว้ โดยเฉพาะอย่างยิ่ง มีความแตกต่างกันอย่างชัดเจนระหว่างการตัดชิ้นเนื้อ (ซึ่งอาจเป็นเพราะเหตุผลทางเทคนิคและทางชีววิทยา) และไม่มีรายละเอียดที่ชัดเจนระหว่างการตัดชิ้นเนื้อระดับ III และ IV ในการศึกษาที่รวมการเพิ่มจำนวน แบบผสม และคลาส V LN และวิเคราะห์ช่องไตและ tubulointerstitial แยกกัน การถอดเสียง RNA จำนวนมากไม่มีความสัมพันธ์กับระดับเนื้อเยื่อวิทยาหรือกิจกรรมของสถาบันสุขภาพแห่งชาติและดัชนีความเรื้อรัง 16 ในทำนองเดียวกันใน การศึกษาชิ้นเนื้อที่จับคู่ 28 ชิ้นจากผู้ป่วย 14 รายที่มี LN ประเมินโดยใช้แผงภูมิคุ้มกัน NanoString ที่คล้ายคลึงกับการศึกษาของเรา ไม่มีกลุ่มที่แตกต่างกันเมื่อวิเคราะห์ความอุดมสมบูรณ์ของการถอดรหัส RNA จากช่องไตหรือ tubulointerstitial ช่อง 18 จุดแข็งที่สำคัญของการศึกษาของเราคือ การเลือกชิ้นเนื้อประเภท III, IV และ V ที่กำหนดไว้อย่างดีโดยไม่มีรอยโรคผสม แม้จะมีแนวทางนี้ และตามข้อตกลงกับการศึกษาที่สรุปไว้ข้างต้น เราไม่สามารถตรวจพบลายเซ็นการถอดเสียงที่แตกต่างกันสำหรับแต่ละประเภทย่อยทางเนื้อเยื่อวิทยา
อย่างไรก็ตาม เราได้ระบุยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน 52 ยีนใน LN ทั้งสามคลาส การวิเคราะห์ STRING แสดงให้เห็นการเพิ่มคุณค่าสำหรับการส่งสัญญาณ IFN, MHC II และการกระตุ้นส่วนเติมเต็มที่ใช้แอนติบอดีแบบคลาสสิก FC ในคลาส IV LN นั้นมีค่ามากกว่าสำหรับยีนเหล่านี้ส่วนใหญ่เมื่อเปรียบเทียบกับคลาส III หรือ V เป็นที่น่าสังเกตว่าการแสดงออกในไตของยีนที่เกี่ยวข้องกับ IFN นั้นได้รับอิทธิพลจากการแพร่กระจายของโรคและการรักษา โดยที่ MX1, STAT1 และ IRF7 ได้รับการควบคุมทั้งหมด ที่ลุกเป็นไฟ และลดลงหรือเพิ่มขึ้นอีกในการตัดชิ้นเนื้อหลังการรักษาของการรักษาหรือไม่ตอบสนอง ตามลำดับ ในการวิเคราะห์นี้และของเรา ไม่สามารถระบุการมีส่วนร่วมของการตอบสนองของ IFN จากเซลล์บุผนังหลอดเลือดของไตและจากเม็ดเลือดขาวที่แทรกซึมเข้าไป สัญญาณจากหลังมีแนวโน้มที่จะได้รับอิทธิพลจากการรักษาด้วยยาต้านการอักเสบมากกว่า เราระบุยีนที่แสดงออกแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญ 105 ยีนในคลาส IV LN โดยที่กลุ่มเสริมสมรรถนะ STRING ทั้งหมดที่ระบุนั้นเกี่ยวข้องกับ NF-κBและการตายของเซลล์ หลักฐานที่สะสมเกี่ยวข้องกับ NF-κBในการเกิดโรคของ LN รวมถึงการบาดเจ็บของ podocyte และการแสดงออกของไซโตไคน์ที่ใช้สื่อกลาง NF-κB ได้รับการเน้นในการไม่ตอบสนอง 19 ความหลากหลายของยีนหลายตัวในการส่งสัญญาณ TLR/ NF-κB เกี่ยวข้องกับ LN รวมถึง TLR 3/7/9, MYD88, IRAK1, TNFAIP3 และ TNIP1, 26 แต่นี่เป็นครั้งแรกที่ NF-κB ได้รับการจัดให้อยู่ในคลาส IV แอลเอ็น. VCAM-1 ได้รับการแนะนำในฐานะตัวชี้วัดทางชีวภาพของกิจกรรม LN27 โดยมีการแสดงออกที่เพิ่มขึ้นระหว่างการตรวจชิ้นเนื้อเริ่มต้นและลุกลาม18 และความสามารถในการแยกความแตกต่างของคลาส IV จากคลาสอื่น ตามข้อตกลง เราสังเกตเห็นเพียงการยกระดับที่สำคัญในการศึกษาของเราในคลาส IV LN การวิเคราะห์ระดับ IV ของเรายังเน้นย้ำถึงกฎระเบียบของกระบวนการเมตาบอลิซึมของ ROS ซึ่งได้รับการรายงานว่ามีบทบาทใน SLE.21 CYBB ซึ่งเป็นยีนที่เข้ารหัสสายโซ่เบต้าของไซโตโครม-245 ซึ่งเป็นหน่วยย่อยของเอนไซม์ NADPH oxidase เชิงซ้อน และมาร์กเกอร์ M2 มาโครฟาจ CD163 เพิ่มขึ้นในทุกคลาสแต่ส่วนใหญ่ทำเครื่องหมายในคลาส IV CD163 ได้รับการแนะนำว่าเป็นตัวชี้วัดทางชีวภาพในปัสสาวะของกิจกรรมใน LN18 การมีอยู่ของการส่งสัญญาณ IFN ประเภท 1 มีความเกี่ยวข้องกับความผิดปกติของไมโตคอนเดรีย ซึ่งนำไปสู่ความไม่เพียงพอของไมโตคอนเดรียและการตายของเซลล์ที่เพิ่มขึ้นในฐานะกลไกการควบคุมในการตอบสนอง IFN แบบถาวรประเภท 121 อย่างไรก็ตาม มันแสดงให้เห็นในแบบจำลองสัตว์ที่การเปลี่ยนแปลงความผิดปกติของการเผาผลาญคือการเปลี่ยนแปลงที่สามารถย้อนกลับได้ในเนื้อเยื่อที่ได้รับผลกระทบจากโรคลูปัส ซึ่งไม่ได้ขับเคลื่อนโดยการเปิดรับ IFN ประเภทที่ 1 และการปรับที่ถูกต้องสามารถฟื้นฟูได้หลังจากการกดภูมิคุ้มกันในแบบจำลองสัตว์ 28 เราสังเกตเห็นเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ STRING ที่คล้ายกันในของเรา คลาส IV เทียบกับคลาส V และการวิเคราะห์คลาส IV เทียบกับ TBM ในความเป็นจริง การเปรียบเทียบทั้งสอง 71.4% (135 จาก 189) ของยีนที่ระบุสัมพันธ์กับ TBM ก็สูงขึ้นอย่างมีนัยสำคัญเช่นกันเมื่อเปรียบเทียบคลาส IV กับคลาส V โดยมีวิถีทางที่ได้รับการเสริมสมรรถนะสำหรับการส่งสัญญาณ IFN ประเภท I, การส่งสัญญาณ JAK-STAT, Complement Cascade MHC II, การจับอินทิกริน, NF-κB และการตายของเซลล์ จากนี้ เราสามารถสรุปได้ว่าการเสริมภูมิคุ้มกันในคลาส IV LN ได้รับการควบคุมอย่างมีนัยสำคัญจากการควบคุมโรคของเรา (การตัดชิ้นเนื้อ TBM) และจากคลาส V LN
การวิเคราะห์เชิงสำรวจระบุว่ากระดูกออสทีพอนติน (OPN/ SPP1), ไฟโบรเนคติน (FN1) และกาเลกติน-3 (LGALS3) เป็นยีนที่น่าสนใจเกี่ยวกับกิจกรรมของโรคลูปัส16 FN1 ยังเชื่อมโยงกับเปลวไฟอีกด้วย18 ในการศึกษาของเรา LGALS3 ไม่ได้แสดงออกอย่างมีนัยสำคัญ อย่างไรก็ตาม FN1 มีนัยสำคัญทั้งในประเภท IV และ V ส่วน OPN มีนัยสำคัญในประเภท IV เท่านั้น การสังเกตไม่ได้ถูกวาดไว้ในการศึกษาดั้งเดิม OPN ได้รับการเสนอให้เป็นเครื่องหมายผู้สมัครของ LN16 ที่ก้าวร้าวและแพร่กระจายและมีความเกี่ยวข้องกับภาวะเซลล์เกิน, การแพร่กระจายของเซลล์และการก่อตัวของเสี้ยวใน murine LN.29 เป้าหมายสำคัญของการศึกษาของเราคือการให้โปรไฟล์การถอดเสียงไตทั้งหมดสำหรับคลาส III, IV และ V LN โดยมีวัตถุประสงค์เพื่อระบุวิถีทางของโมเลกุลและโมเลกุลของการอักเสบที่สามารถกำหนดเป้าหมายสำหรับการบำบัดได้ แม้ว่าเราจะไม่ได้ระบุเส้นทางใหม่สำหรับการกำหนดเป้าหมายใน LN แต่การอนุมัติล่าสุดของ anifrolumab ซึ่งเป็นโมโนโคลนอลแอนติบอดีที่ปิดกั้นมนุษย์ในหน่วยย่อยตัวรับ IFN ประเภท 1 สำหรับการรักษาโรคลูปัสให้โอกาสในการทำความเข้าใจว่าลายเซ็น IFN ในสมองอาจมีอิทธิพลต่อการตอบสนองอย่างไร การยับยั้งคอมพลีเมนต์อาจเป็นการบำบัดที่มีศักยภาพใน LN และการใช้เครื่องหมายเสริมไต เช่น การรวมโปรไฟล์การย้อมสีภูมิคุ้มกันและทรานสคริปโทมิก อาจเป็นวิธีการในการคัดเลือกผู้ป่วยเพื่อพิสูจน์การศึกษาแนวคิด 30
การศึกษาของเรามีข้อจำกัดที่สำคัญ การวิเคราะห์การถอดเสียงถูกจำกัดอยู่ที่การถอดเสียง 750 ครั้งที่ถูกสอบปากคำโดยแผง NanoString ของเรา อย่างไรก็ตาม คณะผู้วิจัยได้รับเลือกเนื่องจากความสามารถในการสอบปากคำบันทึกที่เกี่ยวข้องกับภูมิคุ้มกันและการอักเสบ ซึ่งมีความสำคัญอย่างชัดเจนในการทำความเข้าใจการเกิดโรคระดับโมเลกุลของ LN เราใช้เนื้อเยื่อไตทั้งหมดแทนที่จะแยกเนื้อเยื่อไตและเนื้อเยื่อ tubulointerstitial ดังนั้นเราจึงไม่สามารถแยกแยะการแสดงออกจากช่องไตที่แตกต่างกันได้ การใช้เนื้อเยื่อทั้งหมดมีข้อได้เปรียบในการเป็นแนวทางที่เป็นไปได้ทางเทคนิคมากที่สุดในเชิงทดลองและใช้งานได้จริงมากที่สุดสำหรับการใช้งานทางคลินิกขั้นปลายน้ำ นี่เป็นการศึกษาย้อนหลัง ดังนั้นแนวทางการรักษาจึงไม่เหมือนกัน เราจำกัดการตัดชิ้นเนื้อของเราไว้เฉพาะรอยโรคระดับ III, IV และ V ที่กำหนดไว้อย่างดีโดยไม่มีแผลเป็นอย่างมีนัยสำคัญ เพื่อเพิ่มความสามารถของเราในการตรวจจับความแตกต่างระหว่างแต่ละประเภท วิธีที่สัญญาณจะได้รับผลกระทบจากรอยโรคแบบผสมหรือรอยโรคที่มีความเสียหายเรื้อรัง (เช่น ภาวะหลอดเลือดแข็งตัว, IFTA และ glomerulosclerosis) จำเป็นต้องมีการศึกษาเพิ่มเติม
โดยสรุป เราได้จัดทำการวิเคราะห์การถอดเสียงส่วนของไตทั้งหมดของการตัดชิ้นเนื้อคลาส III, IV และ V LN โดยใช้แผงตรวจยีนภูมิคุ้มกันและการอักเสบ เราระบุวิถีทางทั่วไปของทั้งสามคลาสและวิถีทางเฉพาะที่ได้รับการปรับอย่างมีนัยสำคัญในการตัดชิ้นเนื้อคลาส IV ของเราเท่านั้น เนื่องจากมีการพัฒนาการรักษาที่ตรงเป้าหมายมากขึ้นสำหรับ LN จึงอาจเป็นไปได้ที่จะใช้การวิเคราะห์การถอดเสียงเพื่อแจ้งการเลือกการรักษา
การรับทราบ เราขอขอบคุณผู้ทำงานร่วมกันของผู้ป่วยของเราสำหรับการมีส่วนร่วมกับกลุ่ม MASTERPLANS (https://sites.manchester.ac.uk/ masterplans/) นอกจากนี้เรายังขอขอบคุณ James E. Peters สำหรับความช่วยเหลือในการเขียนโค้ด คำแนะนำทางสถิติ และการสนับสนุน เราขอขอบคุณ University College London Nanostring Facility เรารับทราบการสนับสนุนจากสถาบันวิจัยชีวการแพทย์วิจัยด้านสุขภาพแห่งชาติ ซึ่งตั้งอยู่ที่ Imperial College Healthcare National Health Service Trust และ Imperial College London และจากเครือข่ายการวิจัยทางคลินิกของสถาบันวิจัยด้านสุขภาพแห่งชาติ INB เป็นสถาบันวิจัยสุขภาพแห่งชาติ (NIHR) ในตำแหน่งนักวิจัยอาวุโส และได้รับทุนสนับสนุนจากศูนย์วิจัยชีวการแพทย์แมนเชสเตอร์ NIHR
ผู้ร่วมให้ข้อมูล ACG ดำเนินการทดลอง วิเคราะห์ข้อมูล และร่วมเขียนต้นฉบับ HRW ให้ความช่วยเหลือในการได้มาซึ่งตัวอย่างและฟีโนไทป์ทางคลินิก HTC มอบความเชี่ยวชาญด้านพยาธิวิทยาของไต MB, LL, TDC และ INB ให้ความช่วยเหลือเกี่ยวกับฟีโนไทป์ทางคลินิกและการตีความข้อมูล MCP ดูแลโครงการและร่วมเขียนต้นฉบับและเป็นผู้ค้ำประกัน
งานนี้ได้รับทุนสนับสนุนจากสภาวิจัยทางการแพทย์ ซึ่งให้ทุน MR/ M01665X/1 เรื่อง "การเพิ่มศักยภาพการรักษา SLE สูงสุดโดยการประยุกต์ใช้แนวทางใหม่และระบบและวิศวกรรม (MASTERPLANS)"
ข้อสงวนสิทธิ์ ความคิดเห็นที่แสดงออกมาเป็นความคิดเห็นของผู้เขียน และไม่จำเป็นต้องเป็นความคิดเห็นของบริการสุขภาพแห่งชาติ สถาบันวิจัยสุขภาพแห่งชาติ หรือกรมอนามัย
ผลประโยชน์ที่แข่งขันกันไม่มีการประกาศ
ความยินยอมของผู้ป่วยในการตีพิมพ์ ไม่สามารถใช้ได้
การอนุมัติด้านจริยธรรม ได้รับการอนุมัติด้านจริยธรรมผ่านธนาคารเนื้อเยื่อของวิทยาลัยอิมพีเรียล: MREC 12/WA/0196 โครงการ: R16063 ผู้เข้าร่วมให้ความยินยอมโดยแจ้งให้ทราบเพื่อเข้าร่วมในการศึกษาก่อนเข้าร่วม
แหล่งที่มาและการทบทวนโดยผู้ทรงคุณวุฒิ ไม่ได้รับมอบหมาย; ตรวจสอบโดยเพื่อนจากภายนอก
คำชี้แจงความพร้อมของข้อมูล ข้อมูลมีอยู่ตามคำขอที่สมเหตุสมผล ข้อมูลทั้งหมดที่เกี่ยวข้องกับการศึกษาจะรวมอยู่ในบทความหรืออัปโหลดเป็นข้อมูลเสริม ข้อมูลมีอยู่ในไฟล์ Excel เสริม สามารถขอไฟล์ข้อมูลดิบได้
ข้อมูลอ้างอิง
1 Gasparotto M, Gatto M, Binda V และคณะ โรคไตอักเสบลูปัส: การนำเสนอทางคลินิกและผลลัพธ์ในศตวรรษที่ 21 โรคข้อ 2020;59:v39–51.
2 ฮูเวอร์ พีเจ, คอสเตนบาเดอร์ เคเอช. ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับระบาดวิทยาและการจัดการโรคไตอักเสบลูปัสจากมุมมองของแพทย์โรคไขข้อของสหรัฐอเมริกา ไต Int 2016;90:487–92.
3 Fanouriakis A, Kostopoulou M, Cheema K และคณะ การอัปเดตคำแนะนำของสมาคมไตยุโรปร่วมต่อต้านโรคไขข้ออักเสบและสมาคมไตแห่งยุโรป–สมาคมการฟอกไตและการปลูกถ่ายแห่งยุโรป (EULAR/ ERA–EDTA) ปี 2019 สำหรับการจัดการโรคไตอักเสบลูปัส แอน เรียม ดิส 2020;79:713–23.
4 โมโรนี จี, แวร์เชลโลนี พีจี, ควาลินี เอส และคณะ การเปลี่ยนแปลงรูปแบบในการนำเสนอทางคลินิกและเนื้อเยื่อวิทยาและผลลัพธ์ของไตในช่วงห้าทศวรรษที่ผ่านมาในกลุ่มผู้ป่วยโรคไตอักเสบลูปัส 499 ราย แอน เรียม ดิส 2018;77:1318–2
5. 5 การหย่าร้าง JJ, D'Agati VD, Schwartz MM และคณะ การจำแนกประเภทของ glomerulonephritis ใน systemic lupus erythematosus กลับมาอีกครั้ง เจ แอม ซอค เนโฟรล 2004;15:241–50.
6 Bajema IM, Wilhelmus S, Alpers CE และคณะ การแก้ไขการจำแนกประเภทของสมาคมโรคไตวิทยา/พยาธิวิทยาไตระหว่างประเทศสำหรับโรคไตอักเสบลูปัส: การชี้แจงคำจำกัดความ และการแก้ไขสถาบันกิจกรรมสุขภาพแห่งชาติและดัชนีความเรื้อรัง ไต Int 2018;93:789–96.
7 Haring CM, Rietveld A, van den Brand JAJG และคณะ คลาสย่อยแบบแบ่งส่วนและระดับโลกของกลุ่มไตอักเสบลูปัสคลาส IV มีผลการรักษาไตที่คล้ายคลึงกัน เจ แอม ซอค เนโฟรล 2012;23:149–54.
8 Austin HA, Muenz LR, Joyce KM และคณะ โรคไตอักเสบลูปัสแพร่กระจาย: การระบุลักษณะทางพยาธิวิทยาเฉพาะที่ส่งผลต่อผลลัพธ์ของไต ไต Int 1984;25:689–95.
9 Dall'Era M, Cisternas MG, Smilek DE และคณะ ตัวทำนายผลลัพธ์ของไตในระยะยาวในการทดลองโรคไตอักเสบลูปัส: บทเรียนที่ได้รับจากกลุ่มโรคไตอักเสบยูโร-ลูปัส โรคข้ออักเสบรูมาตอล 2015;67:1305–13.
10 โมโรนี จี, กัตโต เอ็ม, แทมโบรินี เอฟ และคณะ การขาดการตอบสนอง EULAR/ERA-EDTA ที่ 1 ปีคาดการณ์ผลลัพธ์ของไตในระยะยาวที่ไม่ดีในผู้ป่วยโรคไตอักเสบลูปัส แอน เรียม ดิส 2020;79:1077–83.
บริการสนับสนุนของ Wecistanche - ผู้ส่งออก cistanche ที่ใหญ่ที่สุดในประเทศจีน:
อีเมล:wallence.suen@wecistanche.com
Whatsapp/โทรศัพท์:+86 15292862950
เลือกซื้อรายละเอียดข้อมูลจำเพาะเพิ่มเติม:
https://www.xjcistanche.com/cistanche-ร้านค้า
