องค์ประกอบของไมโครไบโอมในลำไส้ยังคงมีเสถียรภาพในบุคคลที่เป็นโรคไตเรื้อรังระยะเริ่มต้นถึงระยะสุดท้าย

นามธรรมt: (1) ความเป็นมา: ผู้ป่วยโรคเบาหวานและโรคไตเรื้อรังแสดงลำไส้ dysbiosis เมื่อเทียบกับการควบคุมสุขภาพ อย่างไรก็ตาม ไม่ทราบว่ามีการเปลี่ยนแปลงใน dysbiosis ตลอดระยะของโรคเบาหวานหรือไม่โรคไตเรื้อรัง. เราตรวจสอบการศึกษาภาคตัดขวางของผู้ป่วยโรคไตเรื้อรังที่เกี่ยวข้องกับโรคเบาหวานในระยะเริ่มต้นและช่วงปลาย เพื่อระบุความแตกต่างของจุลินทรีย์ที่เป็นไปได้ระหว่างสองกลุ่มนี้และในแต่ละระยะของโรคไตเรื้อรังจากเบาหวาน (2) วิธีการ: การศึกษาภาคตัดขวางนี้คัดเลือกผู้ใหญ่ 95 คน ดีเอ็นเอที่สกัดจากตัวอย่างอุจจาระที่เก็บได้ถูกนำมาใช้สำหรับการจัดลำดับ 16S rRNA เพื่อระบุชุมชนแบคทีเรียในลำไส้ (3) ผลลัพธ์: ไฟลัม Firmicutes มีปริมาณมากที่สุดและค่าเฉลี่ยสัมพัทธ์ของมันใกล้เคียงกันในกลุ่มโรคไตเรื้อรังระยะเริ่มต้นและระยะสุดท้าย คือ 45.99 ± 0.58 เปอร์เซ็นต์ และ 49.39 ± 0.55 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ ความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์เฉลี่ยสำหรับวงศ์ Bacteroidaceae ก็ใกล้เคียงกันในกลุ่มต้นและปลาย คือ 29.15 ± 2.02 เปอร์เซ็นต์ และ 29.16 ± 1.70 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ ความอุดมสมบูรณ์ที่ลดลงของ Prevotellaceae ยังคงใกล้เคียงกันทั้งในช่วงต้น 3.87 ± 1.66 เปอร์เซ็นต์และปลาย 3.36 ± 0.98 เปอร์เซ็นต์กลุ่มโรคไตเรื้อรังที่เป็นเบาหวาน (4) สรุป: ข้อมูลที่เกิดขึ้นจากกลุ่มผู้ป่วยโรคไตเรื้อรังที่เกี่ยวข้องกับโรคเบาหวานของเราแสดงให้เห็นความเด่นของไฟลา Firmicutes และ Bacteroidetes ตระกูล Ruminococcaceae และ Bacteroidaceae แสดงถึงความอุดมสมบูรณ์สูงสุด ในขณะที่ตระกูล Prevotellaceae ที่เป็นประโยชน์นั้นมีความอุดมสมบูรณ์ลดลง ข้อสังเกตที่น่าสนใจที่สุดคือปริมาณสัมพัทธ์ของจุลินทรีย์ในลำไส้เหล่านี้ไม่เปลี่ยนแปลงในระยะเริ่มต้นและช่วงท้ายของโรคไตเรื้อรังจากเบาหวาน ซึ่งบ่งชี้ว่านี่เป็นเหตุการณ์แรกเริ่มในการพัฒนาโรคไตเรื้อรังที่เกี่ยวข้องกับโรคเบาหวาน เราตั้งสมมติฐานว่า microbiome dysbiotic ที่ได้รับในช่วงแรกของโรคไตเรื้อรังจากเบาหวานยังคงค่อนข้างคงที่และเป็นเพียงหนึ่งในหลายปัจจัยเสี่ยงที่มีอิทธิพลต่อความผิดปกติของไตที่ก้าวหน้า

คำหลัก: โรคไตเรื้อรัง; โรคเบาหวาน; ดิสไบโอซิส; ไมโครไบโอมในลำไส้; จุลินทรีย์

1. บทนำ

ลำไส้ของมนุษย์มีชุมชนที่ซับซ้อนกว่า 100 ล้านล้านเซลล์จุลินทรีย์ที่ประกอบกันเป็นไมโครไบโอต้าในลำไส้ พวกมันก่อตัวเป็นระบบนิเวศแบบไดนามิกและอยู่ร่วมกันซึ่งมีปฏิสัมพันธ์อย่างต่อเนื่องกับเมแทบอลิซึมของโฮสต์ที่มีอิทธิพลต่อโภชนาการ สรีรวิทยา และการทำงานของภูมิคุ้มกัน ความหลากหลายของจุลินทรีย์เพิ่มขึ้นและรวมกันเป็นไมโครไบโอต้าที่เหมือนตัวเต็มวัยเมื่อสิ้นสุดช่วง 3-5 ปีแรกของชีวิต เมื่อสร้างแล้ว องค์ประกอบ หน้าที่ และโครงสร้างของจุลินทรีย์ในลำไส้จะค่อนข้างคงที่ตลอดช่วงชีวิตของบุคคลที่มีสุขภาพแข็งแรง แม้ว่าจะมีการปรับตัวให้เข้ากับสภาพแวดล้อมทางชีวเคมีของระบบทางเดินอาหาร (GI) และการเปลี่ยนแปลงในความพร้อมของสารอาหาร ซึ่งเป็นตัวแทนของตัวควบคุมที่สำคัญของเมแทบอลิซึมของแบคทีเรีย แบคทีเรียไฟลา Firmicutes และ Bacteroidetes ประกอบขึ้นเป็นไมโครไบโอมในลำไส้ที่ดีต่อสุขภาพเป็นส่วนใหญ่ อย่างไรก็ตาม องค์ประกอบของความหลากหลายของแบคทีเรียนี้ดูเหมือนจะเปลี่ยนไปในโรคไม่ติดต่อ เช่น โรคอ้วน เช่นเดียวกับผู้ที่เป็นเบาหวานชนิดที่ 2

โรคเบาหวานและภาวะแทรกซ้อนทางจุลภาคและหลอดเลือดใหญ่ที่เกี่ยวข้องมีสัดส่วนการแพร่ระบาดสูง โดยมีความชุกทั่วโลก 463 ล้านคน ผู้ป่วยเบาหวานมากกว่าร้อยละ 40 มีพัฒนาการที่เกี่ยวข้องกับโรคเบาหวานโรคไตเรื้อรัง (CKD)ซึ่งยังคงอยู่

สาเหตุหลักของโรคไตระยะสุดท้าย (ESKD)ทั่วโลกทำให้ต้องฟอกไตระยะยาว โรคหัวใจและหลอดเลือดเป็นสาเหตุการตายอันดับต้น ๆ ของผู้ที่เป็นโรค CKD ส่วนหนึ่งเกิดจากการอักเสบระดับต่ำอย่างต่อเนื่อง ไม่น่าแปลกใจเลยที่ตอนนี้เบาหวานขึ้นตาถือเป็นปัญหาสุขภาพระดับโลก

งานวิจัยหลายชิ้นได้รายงานการเปลี่ยนแปลงองค์ประกอบของจุลินทรีย์ในลำไส้ในมนุษย์ที่เป็นเบาหวานเมื่อเปรียบเทียบกับกลุ่มควบคุม และตัวอย่าง ได้แก่ สัดส่วนที่ลดลงของไฟลัม Firmicutes และคลาส Clostridia ในผู้ที่เป็นเบาหวานชนิดที่ 2 เมื่อเทียบกับกลุ่มควบคุมที่ดีต่อสุขภาพ นอกจากนี้ยังแสดงให้เห็นว่าบุคคลทั่วไปที่เป็นโรคเบาหวานแสดงความหลากหลายของแบคทีเรียที่ลดลงโดยมีลักษณะการลดลงของแบคทีเรียที่ผลิต butyrate เช่น Faecalibacterium prausnitzii และ Roseburia intestinalis พร้อมกับการเพิ่มขึ้นของเชื้อโรคฉวยโอกาส

การวิจัยในรูปแบบสัตว์ทดลองของโรคไตเรื้อรัง (CKD)และผู้ป่วยระยะต่างๆโรคไตวายเรื้อรังแสดงให้เห็นถึงการเปลี่ยนแปลงของไมโครไบโอมในลำไส้ปกติ สภาวะโรคเรื้อรัง เช่น โรคไตวายเรื้อรังที่เป็นเบาหวาน โดยกลไกทางพยาธิสรีรวิทยาหลายอย่าง ทำให้เกิดสภาวะ "การย่อยสลายในลำไส้" ของจุลินทรีย์ในลำไส้ที่อาจส่งผลให้เกิดการตอบสนองต่อการอักเสบอย่างเป็นระบบ การเปลี่ยนแปลงที่โดดเด่นของภาวะ dysbiosis ในลำไส้คือการลดลงของจุลินทรีย์ที่มีประโยชน์ซึ่งผลิตกรดไขมันสายสั้น (SCFA) และในกรณีของ CKD การเพิ่มขึ้นของแบคทีเรียที่ย่อยสลายโปรตีน เช่น Clostridium spp. และแบคเทอรอยเดส เป็นที่รู้กันว่าคนที่มีโรคไตมีระดับยูเรียในเลือดหรือยูเรียไนโตรเจนในเลือด (BUN) ในระดับที่สูงขึ้นเนื่องจากความบกพร่องไตการกวาดล้างสารพิษในปัสสาวะเหล่านี้และเพิ่มปริมาณยูเรียในลำไส้ การเพิ่มขึ้นนี้ได้รับการเสนอเพื่อนำไปสู่การผลิตแอมโมเนียสูงจากการไฮโดรไลซิสของยูเรียที่มีแบคทีเรียเป็นสื่อกลาง ซึ่งจะเพิ่มค่า pH ของลูมินัลและช่วยเพิ่มการเจริญเติบโตของสายพันธุ์โปรตีโอไลติก เช่น สายพันธุ์ Clostridium ใน CKD 'สภาพแวดล้อมที่มียูเรมิก' นี้ไม่มีอยู่ในบุคคลที่เป็นเบาหวานเท่านั้น (ไม่ใช่ CKD) ดังนั้นบุคคลเหล่านี้จึงไม่แสดงการเพิ่มขึ้นของสายพันธุ์ Clostridium เนื่องจากมากกว่าร้อยละ 90 ของประชากรทั้งหมดของจุลินทรีย์ในลำไส้ของมนุษย์ที่มีสุขภาพดีมีไฟลาเด่นสองชนิด ได้แก่ Firmicutes และ Bacteroidetes เมื่อเปรียบเทียบกับบุคคลที่เป็นเบาหวานกับกลุ่มควบคุมที่ดีต่อสุขภาพ มีการเปลี่ยนแปลงองค์ประกอบของไมโครไบโอมซึ่งประกอบด้วย Firmicutes ที่ลดลง ในผู้ที่เป็นเบาหวานเมื่อเทียบกับคนที่มีสุขภาพดี

จุดเด่นเพิ่มเติมของภาวะ dysbiosis ในลำไส้คือการลดลงของจุลินทรีย์ตระกูล saccharolytic ที่เป็นประโยชน์ เช่น Prevetoellaceae ซึ่งผลิตกรดไขมันสายสั้น เช่น butyrate กรดไขมันสายสั้นเหล่านี้ช่วยรักษาความสมบูรณ์ของสิ่งกีดขวางในลำไส้ และจะลดลงในผู้ที่เป็นโรค CKD เมื่อเทียบกับผู้ที่มีสุขภาพดี บุคคลที่เป็นโรคเบาหวานมักเกี่ยวข้องกับโรค metabolic syndrome ในการศึกษาในมนุษย์ที่ประเมินความหลากหลายของจุลินทรีย์ในลำไส้กับลักษณะของกลุ่มอาการเมตาบอลิซึม ผู้เขียนได้แสดงให้เห็นว่าความหลากหลายของจุลินทรีย์ที่ไม่ดีนั้นสัมพันธ์กับโรคอ้วน ภาวะดื้อต่ออินซูลิน ไขมันในตับ และการอักเสบในระดับต่ำ พวกเขาแสดงให้เห็นว่าอาสาสมัครดังกล่าวมีลักษณะของเชื้อจุลินทรีย์ที่มีการอักเสบมากขึ้น โดยมีลักษณะเด่นคือการลดแบคทีเรียที่ผลิต butyrate

แม้จะมีภาระโรค แต่กลไกทางพยาธิสรีรวิทยาที่สนับสนุนการลุกลามของโรค CKD ที่เป็นเบาหวานนั้นยังไม่เป็นที่เข้าใจ ผู้ป่วยเบาหวาน CKD มีลักษณะเฉพาะคือ ความดันโลหิตสูง อัลบูมินูเรีย และการลดลงอย่างต่อเนื่องของการทำงานของไตวัดจากการเปลี่ยนแปลงของอัตราการกรองของไตโดยประมาณ (eGFR) บทบาทของไมโครไบโอมในลำไส้ในการลุกลามของโรค CKD ที่เป็นเบาหวานได้กลายเป็นประเด็นที่น่าสนใจทางวิทยาศาสตร์ ผู้ที่เป็นเบาหวานและโรคไตเรื้อรังแสดงลำไส้ dysbiosis เมื่อเทียบกับการควบคุม อย่างไรก็ตาม ไม่ทราบว่ามีการเปลี่ยนแปลงใน dysbiosis นี้ตลอดระยะของ CKD ที่เป็นเบาหวานหรือไม่ ดังนั้น การศึกษานี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อทำการวิเคราะห์ภาคตัดขวางของโปรไฟล์ไมโครไบโอมในลำไส้ของผู้ป่วยที่เป็นเบาหวานระยะแรกและระยะหลังที่เกี่ยวข้องกับโรคไตวายเรื้อรัง เพื่อระบุความแตกต่างของจุลินทรีย์ที่เป็นไปได้ระหว่างสองกลุ่มนี้และในแต่ละระยะของโรคไตวายเรื้อรัง

คลิกเพื่อเสริม Cistanche Tubulosa

สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม:david.deng@wecistanche.com

2. วัสดุและวิธีการ

2.1. ผู้เข้าร่วม

การศึกษาภาคตัดขวางในอนาคตนี้คัดเลือกผู้ใหญ่ 95 คน เป็นเวลามากกว่า 6 เดือน ณ เวลาที่เข้ารับการตรวจที่คลินิกต่อมไร้ท่อของผู้ป่วยนอก ผู้ป่วยยินยอมให้เก็บตัวอย่างอุจจาระเพื่อแยก DNA นอกเหนือไปจากการตรวจเลือดตามปกติในการนัดตรวจผู้ป่วยนอก ผู้ป่วยเหล่านี้เป็นเบาหวานหลายระยะ (ระยะที่ 1-5)โรคไตเรื้อรัง. ผู้ป่วยถูกแบ่งออกเป็น 2 กลุ่มที่แตกต่างกัน: 'CKD ระยะเริ่มต้น' และ 'CKD ระยะสุดท้าย' กลุ่มผู้ป่วย CKD ที่เป็นเบาหวานระยะแรกถูกกำหนดให้เป็นผู้เข้าร่วมที่เป็นเบาหวานที่มี CKD ระยะที่ 1, 2 หรือ 3a ในขณะที่กลุ่ม CKD ที่เป็นเบาหวานช่วงปลายถูกกำหนดให้เป็นผู้เข้าร่วม เป็นเบาหวานที่มีระยะ 3b, 4 หรือ 5 CKD ที่เกี่ยวข้องกับโรคเบาหวานโรคไตเรื้อรังเป็น= คำศัพท์ที่ต้องการซึ่งครอบคลุมช่วงของรอยโรคทางเนื้อเยื่อไตที่อาจสังเกตเห็นได้ CKD ถูกกำหนดโดยการทำงานของไตที่ลดลงทีละน้อย โดยวัดจากการเปลี่ยนแปลงของอัตราการกรองของไตโดยประมาณ (eGFR) โดยมีหรือไม่มีอัลบูมินูเรีย หากมีให้ประเมินอัลบูมินูเรียโดยการวัดอัตราส่วนอัลบูมินต่อครีเอตินินในปัสสาวะ (ACR) ในตัวอย่างปัสสาวะเฉพาะจุดในเวลาเดียวกับการให้ตัวอย่างเลือดดำ Microalbuminuria ถูกกำหนดเป็น ACR ที่ 30–300 mg/g และ macroalbuminuria ถูกกำหนดเป็น ACR > 300 mg/g CKD แบ่งเป็น 6 ระยะ — ระยะที่ 1 (eGFR มากกว่าหรือเท่ากับ 90 มล./นาที/1.73 ตร.ม.), 2 (eGFR 60–89 มล./นาที/1.73 ตร.ม.), 3a (eGFR 45–59 มล./นาที/1.73 ตร.ม. ), 3b (eGFR 30–44 mL/min/1.73 m2), 4 (eGFR 20–29 mL/min/1.73 m2) และ 5 (eGFR < 20 mL/min/1.73 m2) ความเสี่ยงของการเสียชีวิตจากสาเหตุใดๆ เหตุการณ์เกี่ยวกับหัวใจและหลอดเลือด หรือการรักษาตัวในโรงพยาบาลจะเพิ่มขึ้นเป็นทวีคูณตั้งแต่ระยะที่ 3b เป็นต้นไป

การรวบรวมข้อมูลเกิดขึ้น ณ จุดเดียวและรวมถึงข้อมูลเกี่ยวกับความดันโลหิต โรคประจำตัว ระยะเวลาของโรคเบาหวาน ระยะของ CKD และภาวะแทรกซ้อนที่เกี่ยวข้อง ยา และผลทางพยาธิวิทยา ข้อมูลมานุษยวิทยาและตัวอย่างอุจจาระถูกรวบรวมในวันที่ไปคลินิก ในขณะที่ข้อมูลส่วนที่เหลือของผู้ป่วยถูกรวบรวมผ่านการเข้าถึงเวชระเบียนอิเล็กทรอนิกส์ของ Austin Health จากนั้นข้อมูลทั้งหมดที่คัดเลือกมานี้จะถูกป้อนลงในฐานข้อมูลเฉพาะสำหรับการศึกษาวิจัยนี้เพื่อการวิเคราะห์ในภายหลัง มีผู้เข้าร่วม 70 คนในกลุ่มที่เป็นเบาหวานระยะเริ่มต้นและ 25 คนในกลุ่มปลาย ผู้เข้าร่วมให้ความยินยอมเป็นลายลักษณ์อักษรและการศึกษาได้รับการอนุมัติโดยคณะกรรมการจริยธรรมการวิจัยในมนุษย์ของ Austin Health รัฐวิกตอเรีย ประเทศออสเตรเลีย (HREC/17/Austin/166 หมายเลขโครงการ ND 17/166 โดยได้รับการอนุมัติจาก HREC เมื่อวันที่ 13/07/2017) และ คณะกรรมการจริยธรรมการวิจัยในมนุษย์แห่งมหาวิทยาลัยดีกิ้น ประเทศออสเตรเลีย ขั้นตอนที่ตามมาคือปฏิญญาเฮลซิงกิปี 1975 ซึ่งแก้ไขในปี 2013

2.2. การเก็บอุจจาระ

หลังจากรวบรวมโดยผู้บริจาคในภาชนะบรรจุตัวอย่างขนาด 50 มล. ตัวอย่างจะถูกแบ่งส่วนประมาณ 0.5–1 กรัมลงในหลอด Eppendorf ที่มีขนาดเล็กกว่า 1.5 มล. ก่อนแช่แข็งที่ −80 ◦C เพื่อการสกัดดีเอ็นเอในอนาคต

2.3. การสกัดดีเอ็นเอ

สกัด DNA โดยใช้ Qiagen QIAamp® DNA Stool Mini Kit (Ref 51504, Hilden, Germany) ตามโปรโตคอลของผู้ผลิต ประเมินปริมาณและการทำให้บริสุทธิ์ของ DNA โดยใช้ Qubit fluorometer (Invitrogen) การสกัดดีเอ็นเอจากอุจจาระได้ดำเนินการหลังจากการรับสมัครผู้ป่วย

2.4. การสร้างโปรไฟล์ DNA Microbiome และการควบคุมคุณภาพ

การขยายและการหาลำดับ PCR ดำเนินการโดย Australian Genome Research Facility (AGRF, Melbourne, Australia) แอมพลิคอน PCR ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ไพรเมอร์และเงื่อนไขที่ระบุไว้ในตารางที่ 1 เสร็จสิ้นการทำเทอร์โมไซเคิลด้วย Applied Biosystem 384 Veriti และใช้ AmpliTaq Gold 360 master mix (Life Technologies, Mulgrave, VIC, Australia) สำหรับ PCR หลัก PCR ขั้นแรกทำความสะอาดโดยใช้เม็ดแม่เหล็ก และตัวอย่างถูกมองเห็นด้วย SYBR Agarose E-Gel 2 เปอร์เซ็นต์ (Thermo-Fisher, Mulgrave, VIC, ออสเตรเลีย) PCR รองเพื่อจัดทำดัชนีแอมพลิคอนได้ดำเนินการด้วย TaKaRa Taq DNA Polymerase (Takara Bio USA, Inc., Mountain View, CA, USA) แอมพลิคอนที่ได้นั้นได้รับการทำความสะอาดอีกครั้งโดยใช้เม็ดแม่เหล็กและวัดปริมาณด้วย QuantiFluor fluorometer (Promega, Madison, WI, USA) ก่อนการทำให้เป็นมาตรฐาน ตัวอย่างถูกรวมเข้าด้วยกันในความเข้มข้นที่เท่ากันก่อนที่จะทำความสะอาดครั้งสุดท้ายโดยใช้เม็ดแม่เหล็กเพื่อทำให้สระมีสมาธิ จากนั้นวัดโดยใช้เทปความไวสูง D1000 บนระบบ TapeStation ของ Agilent 2200 พูลถูกเจือจางเป็น 5 นาโนโมลาร์และยืนยันโมลาริตีอีกครั้งโดยใช้เทป D1000 ความไวสูง ตามมาด้วยการจัดลำดับบน Illumina MiSeq (ซานดิเอโก แคลิฟอร์เนีย สหรัฐอเมริกา) ด้วยชุดวงจร V 3, 600 (คู่เบส 2 × 300 คู่ปลาย)

การอ่านแบบจับคู่ถูกรวบรวมโดยการจัดแนวการอ่านไปข้างหน้าและย้อนกลับโดยใช้ PEAR (เวอร์ชัน 0.9.5) ไพรเมอร์ถูกระบุและตัดแต่ง ลำดับที่ตัดแต่งได้รับการประมวลผลโดยใช้ Quantitative Insights Into Microbial Ecology (QIIME 1.8) USEARCH (เวอร์ชัน 7.1.1090) และซอฟต์แวร์ UPARSE การใช้ USEARCH ลำดับจะถูกกรองคุณภาพ จากนั้นลำดับที่ซ้ำกันแบบเต็มความยาวจะถูกลบออกและจัดเรียงตามจำนวนมากมาย Singletons หรือการอ่านที่ไม่ซ้ำกันในชุดข้อมูลถูกยกเลิก ลำดับถูกจัดกลุ่มตามด้วยการกรองไคเมร่าโดยใช้ฐานข้อมูล "rdp_gold" เป็นข้อมูลอ้างอิง เพื่อให้ได้จำนวนการอ่านในแต่ละหน่วยอนุกรมวิธานการปฏิบัติงาน (OTU) การอ่านจะถูกแมปกลับไปที่ OTU ด้วยข้อมูลประจำตัวขั้นต่ำที่ 97 เปอร์เซ็นต์ การใช้ QIIME การจัดอนุกรมวิธานถูกกำหนดโดยใช้ฐานข้อมูล Greengenes (เวอร์ชัน 13_8, สิงหาคม 2013)

2.5. การล้างข้อมูล การทำให้เป็นมาตรฐาน และการวิเคราะห์ทางสถิติ

ตัวแปรตามหมวดหมู่สำหรับลักษณะเฉพาะของผู้ป่วยได้รับการทดสอบโดยใช้ Fisher's Exact และตัวแปรต่อเนื่องได้รับการทดสอบด้วยการทดสอบอันดับ Wilcoxon-signed

ข้อมูลถูกตัดเพื่อลบตัวแทนที่จำแนกตาม Archaea (N=4), คลอโรพลาสต์ (N=42) และ OTU ที่ไม่ได้กำหนด 22 รายการที่นำไปใช้ในแพ็คเกจ 'phyloseq' ในโปรแกรมสถิติ R เวอร์ชัน 1.26.1 นอกจากนี้ เรายังลบ OTU ที่มีความชุกน้อยกว่า 2 รายการ ซึ่งทำให้จำนวนที่บันทึกต่อตัวอย่างมีการกระจายอย่างเท่าเทียมกันมากขึ้น แท็กซ่าที่เหลืออีก 1,818 ตัวถูกจัดอยู่ใน Kingdom Bacteria โดย 69.03 เปอร์เซ็นต์ถูกกำหนดให้อยู่ในระดับไฟลัม เราแสดงภาพความชุกชุมของแบคทีเรีย (ความชุกชุม > 2 เปอร์เซ็นต์) ในตัวอย่างประเภทต่างๆ โดยจำแนกตามระดับไฟลัมและสกุล

เราคำนวณจำนวน OTU ที่สังเกตได้และเปรียบเทียบความหลากหลายของอัลฟ่า (ภายในกลุ่มตัวอย่าง) ของบุคคลที่ถูกจัดกลุ่มตามระยะ CKD โดยใช้ดัชนีแชนนอน ซึ่งพิจารณาทั้งความอุดมสมบูรณ์และความสม่ำเสมอของแท็กซ่าที่มีอยู่ Boxplots ของดัชนีความหลากหลายอัลฟ่าถูกสร้างขึ้นโดยใช้คำสั่ง boxplot ในฐาน R เนื่องจากข้อมูลของเรามีค่าผิดปกติที่อาจเกิดขึ้นและไม่ได้กระจายตามปกติ ความแตกต่างระหว่างค่าเฉลี่ยของกลุ่มตัวอย่างจึงถูกทดสอบด้วยการทดสอบ Kruskal-Wallis แบบไม่มีพารามิเตอร์ โดยใช้คำสั่ง Kruskal ทดสอบ.

สำหรับความหลากหลายเบต้า (ระหว่างตัวอย่าง) เราใช้การแปลงบันทึกของข้อมูลที่ปรับขนาดเพื่ออ่านความลึกต่อตัวอย่าง จากนั้นคำนวณและลงจุด UniFrac แบบถ่วงน้ำหนัก ซึ่งให้การวัดความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์และความแตกต่างทางสายวิวัฒนาการ ระยะห่างของ UniFrac ที่น้อยลงระหว่างสองตัวอย่างบ่งชี้ว่ามีความคล้ายคลึงกันมากขึ้นระหว่างชุมชนจุลินทรีย์ทั้งสอง ระยะทาง UniFrac ถูกแสดงภาพโดยใช้แผนการวิเคราะห์พิกัดหลัก (PCoA) โดยใช้คำสั่งจากแพ็คเกจ 'phyloseq' การวิเคราะห์พิกัดหลัก (PCoA) เป็นวิธีการลดขนาดที่แสดงความสัมพันธ์ระหว่างตัวอย่างที่ขึ้นอยู่กับเมทริกซ์ระยะทาง และแสดงภาพรูปแบบการจัดกลุ่มที่ไม่มีการควบคุมของชุดข้อมูลที่ซับซ้อน เช่น ไมโครไบโอม เราใช้คำสั่ง adonis จากแพ็คเกจ 'vegan' เพื่อทำการวิเคราะห์ความแปรปรวนหลายตัวแปรเรียงสับเปลี่ยน (PERMANOVA) เพื่อตรวจสอบว่าชุมชนจุลินทรีย์ของแต่ละกลุ่มตัวอย่างมีความแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญหรือไม่ ผลลัพธ์สำหรับการทดสอบทางสถิติทั้งหมดได้รับการพิจารณาว่ามีนัยสำคัญโดยที่ค่า p<0.05.

3. ผลลัพธ์

ลักษณะทางคลินิกและชีวเคมี

หลังจากการควบคุมคุณภาพตัวอย่าง มีข้อมูลสำหรับตัวอย่างผู้ป่วย 95 ตัวอย่าง ลักษณะทางคลินิกและทางชีวเคมีของประชากรที่ศึกษา 95 คนแสดงไว้ในตารางที่ 2 ค่าเฉลี่ย eGFR คือ 67.51 มล./นาที/1.73 ตร.ม. ในช่วงแรกโรคไตเรื้อรังจากเบาหวานกลุ่ม (ประกอบด้วยระยะ 1, 2 และ 3a CKD) และ 24.48 มล./นาที/1.73 ตร.ม. ในช่วงท้ายโรคไตเรื้อรังจากเบาหวานบุคคล (ประกอบด้วยระยะ 3b, 4 และ 5) สิ่งนี้มีนัยสำคัญทางสถิติด้วย p-value < 0.001 (การทดสอบอันดับ Wilcoxon Signed) อายุเฉลี่ยในกลุ่ม CKD ระยะแรกน้อยกว่าอย่างมีนัยสำคัญที่ 66.24 ปี เทียบกับ 72.68 ปีในกลุ่ม CKD ระยะหลัง (p-value=0.01) สัดส่วนของผู้ป่วยที่ได้รับการคัดเลือก 95 รายในแต่ละระยะของ CKD เบาหวานแสดงไว้ในรูปที่ 1

ดัชนีความหลากหลายเบต้าใช้เพื่ออธิบายความหลากหลายทางนิเวศวิทยาระหว่างตัวอย่างชุมชนจุลินทรีย์ ความหลากหลายเบต้าของไมโครไบโอมในลำไส้ไม่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญระหว่างกลุ่มผู้ป่วยเบาหวานที่เป็นโรคไตระยะแรกและระยะปลายหรือระหว่างแต่ละระยะของโรคไตวายเรื้อรังเมื่อเปรียบเทียบกับกลุ่มอื่น (PERMANOVA, p-value=0.70, รูปที่ 2A, ข).

รูปที่ 1 สัดส่วนของผู้ป่วยเบาหวานแต่ละระยะของโรคไตเรื้อรัง (CKD)

ดัชนีความหลากหลายอัลฟ่ามักใช้เพื่ออธิบายความหลากหลายทางนิเวศวิทยาภายในตัวอย่างชุมชนจุลินทรีย์ ดัชนีแชนนอนพิจารณาทั้งความร่ำรวยและความสม่ำเสมอของสายพันธุ์ ความหลากหลายอัลฟ่าของไมโครไบโอมในลำไส้ไม่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญระหว่างกลุ่มที่เป็นเบาหวานระยะแรกและระยะหลัง (ดัชนีแชนนอน, การทดสอบ KruskalWallis, p-value น้อยกว่าหรือเท่ากับ 0.05) หรือระหว่างแต่ละระยะของ เบาหวาน CKD เมื่อเปรียบเทียบกับที่อื่น (รูปที่ 3A, B)

รูปที่ 2 (A) การวิเคราะห์พิกัดหลัก (PCoA) (B) แผนผังแสดงความแตกต่างของชุมชนแบคทีเรียในลำไส้จากบุคคลที่มีโรคไตวายเรื้อรัง

รูปที่ 3.(A) แผนภาพกล่องและหนวดแสดงหน่วยอนุกรมวิธานปฏิบัติการของแบคทีเรีย (OTU) หลายหน่วยที่สังเกตได้และดัชนีความหลากหลายของตัวอย่างอุจจาระของแชนนอนที่จัดกลุ่มตามบุคคลที่มีระยะเริ่มต้น (1 ถึง 3a) และช่วงปลาย (3b ถึง 5) ของ CKD (B ). แผนภาพกล่องและหนวดแสดงจำนวนหน่วยอนุกรมวิธานปฏิบัติการของแบคทีเรียที่สังเกตได้ (OTUs) และดัชนีความหลากหลายของตัวอย่างอุจจาระของแชนนอนที่จัดกลุ่มตามบุคคลที่ระยะ CKD 1,2,3a,3b,4 และ 5

The majority (>ความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์เฉลี่ย 85 เปอร์เซ็นต์) ของหน่วยอนุกรมวิธานปฏิบัติการของแบคทีเรีย (OTUs) ที่ระบุถึงระดับอนุกรมวิธานของไฟลัมในไมโครไบโอมในลำไส้ของบุคคลที่มีระยะต่างๆ ของโรค CKD ถูกแสดงโดย phyla Bacteroidetes และ Firmicutes ไฟลัม Firmicutes มีมากที่สุดและความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์เฉลี่ยใกล้เคียงกันในช่วงต้น (ระยะ 1, 2 และ 3a) และช่วงหลัง (ระยะ 3b, 4 และ 5) กลุ่ม CKD ซึ่งคิดเป็น 45.99 ± 0 58 เปอร์เซ็นต์ใน CKD ระยะแรกและ 49.39 ± 0.55 เปอร์เซ็นต์ใน CKD ระยะหลัง ในทำนองเดียวกัน ค่าเฉลี่ยสัมพัทธ์ของไฟลัมแบคเทอรอยเดตก็ใกล้เคียงกันในกลุ่ม CKD เบาหวานระยะแรก คิดเป็น 42.86 ± 1.40 เปอร์เซ็นต์ และ 41.20 ± 1.12 เปอร์เซ็นต์ในกลุ่ม CKD เบาหวานระยะสุดท้าย (รูปที่ 4A). ในระดับครอบครัว Bacteroidaceae และ Ruminococcaceae เป็นตัวแทนของ OTUs ที่มีอยู่มากมายในกลุ่ม CKD ในช่วงต้นและปลายในขณะที่ Prevotellaceae มีความอุดมสมบูรณ์ต่ำที่สุดในทุกระยะของ CKD ที่เป็นเบาหวาน โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์เฉลี่ยของครอบครัว Bacteroidaceae มีความคล้ายคลึงกันในผู้ป่วยเบาหวานที่เป็นเบาหวานระยะแรกและระยะปลาย โดยคิดเป็นร้อยละ 29.15 ± 20ร้อยละ 2 ในกลุ่มที่เป็นโรคไตเรื้อรังระยะแรก และร้อยละ 29.16 ± 1.70 ในกลุ่มที่เป็นโรคไตเรื้อรังระยะหลัง ความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์เฉลี่ยของ Ruminococcaceae ก็ใกล้เคียงกันใน CKD ระยะแรกและช่วงปลาย ซึ่งประกอบด้วย 20.49 ± 0.61 เปอร์เซ็นต์สำหรับ CKD ระยะแรก และ 20.22 ± 0.44 เปอร์เซ็นต์สำหรับ CKD ระยะหลัง ความอุดมสมบูรณ์ที่ต่ำกว่าของ Prevotellaceae ยังคงใกล้เคียงกันทั้งในระยะเริ่มต้นและช่วงปลายของ CKD ซึ่งคิดเป็นเพียงร้อยละ 3.87 ± 1.66 สำหรับ CKD ระยะแรกและ 3.36 ± 0.98 เปอร์เซ็นต์สำหรับ CKD เบาหวานช่วงปลาย (รูปที่ 4B)

รูปที่ 4. (ก). แผนภูมิแท่งแบบเรียงซ้อนแสดงความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์โดยเฉลี่ยของหน่วยอนุกรมวิธานปฏิบัติการของแบคทีเรีย (OTU) ที่ระบุถึงระดับอนุกรมวิธานของไฟลัมในจุลินทรีย์ในลำไส้ของบุคคลที่มีระยะต่างๆ ของโรค CKD ความอุดมสมบูรณ์ถูกคำนวณจากข้อมูลที่ตัดแต่งเพื่อลบ OTU ที่แพร่หลายใน<2 samples with <2 counts in the complete dataset. (B). Stacked bar charts display the average relative abundance of bacterial operational taxonomic units (OTUs) identified to the taxonomic level of family in the gut microbiome of individuals with different stages of CKD disease. Abundances were calculated from trimmed data to remove OTUs that were prevalent in <2 samples with <2 counts in the complete dataset.

สกุล Faecalibacterium, Bifidobacterium, Bacteroides และ Akkermansia ซึ่งเป็นที่ทราบกันดีว่ามีความสัมพันธ์เชิงลบกับเบาหวานชนิดที่ 2 ไม่ได้แสดงให้เห็นถึงความแตกต่างที่มีนัยสำคัญในความชุกชุมสัมพัทธ์ของ CKD ที่เป็นเบาหวานระยะแรกหรือระยะหลังในการศึกษาของเรา (รูปที่ 5A–D) Phyla Actinobacteria และ Firmicutes ซึ่งแสดงให้เห็นว่ามีการเจริญเติบโตของลำไส้มากเกินไปในผู้ป่วยโรคไตวายเรื้อรัง แสดงให้เห็นอีกครั้งว่าไม่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในความชุกชุมสัมพัทธ์ในผู้ป่วยเบาหวานที่เป็นเบาหวานระยะแรกหรือระยะหลัง (รูปที่ 6A) ไมโครไบโอมในลำไส้ในแบบจำลองสัตว์ที่มียูเรมิกมีความสัมพันธ์กับองค์ประกอบที่ลดลงของ Prevotellaceae ในการศึกษาของเรา สกุล Prevotella ในตระกูล Prevotellaceae ไม่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในความชุกชุมสัมพัทธ์ใน CKD ที่เป็นเบาหวานระยะแรกหรือระยะหลัง (รูปที่ 6B)

รูปที่ 5 (A): โครงร่างกล่องและหนวดแสดงความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ของสกุล Ruminococcus และ Faecalibacterium ระหว่างกลุ่ม CKD ในช่วงต้นและปลาย ns หมายถึงไม่มีนัยสำคัญ (B): โครงร่างกล่องและหนวดแสดงความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ของสกุล Bifidobacterium ระหว่างกลุ่ม CKD ในช่วงต้นและปลาย ns หมายถึงไม่มีนัยสำคัญ (C): โครงร่างกล่องและหนวดแสดงความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ของสกุล Bacteroides ระหว่างกลุ่ม CKD ในช่วงต้นและปลาย (D): โครงร่างกล่องและหนวดแสดงความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ของสกุล Akkermansia ระหว่างกลุ่ม CKD ในช่วงต้นและปลาย ns หมายถึงไม่มีนัยสำคัญ

รูปที่ 6 (A): โครงร่างกล่องและหนวดแสดงความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ของ phyla Firmicutes และ Actinobacteria ระหว่างกลุ่ม CKD ในช่วงต้นและปลาย ns หมายถึงไม่มีนัยสำคัญ (B): โครงร่างกล่องและหนวดแสดงความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ของสกุล Prevotella ระหว่างกลุ่ม CKD ในช่วงต้นและปลาย ns หมายถึงไม่มีนัยสำคัญ

4. การอภิปราย

วรรณกรรมที่สำคัญแสดงหลักฐานสำหรับบทบาทของจุลินทรีย์ในลำไส้ในกระบวนการโรคเมตาบอลิซึมเรื้อรัง รวมถึงเบาหวานชนิดที่ 2 ในบรรดาการค้นพบที่มีการรายงานโดยทั่วไป สกุลของ Bifidobacterium, Bacteroides, Faecalibacterium, Akkermansia และ Roseburia มีความสัมพันธ์เชิงลบกับโรคเบาหวานประเภท 2 ในขณะที่สกุลของ Ruminococcus, Fusobacterium และ Blautia มีความสัมพันธ์เชิงบวกกับโรคเบาหวานประเภท 2 จุลินทรีย์ในลำไส้สามารถปรับตัวได้สูงต่อการเปลี่ยนแปลงสภาพแวดล้อมทางชีวเคมี ในขณะที่การศึกษาล่าสุดโดย Vaziri et al. ได้แสดงจำนวนแบคทีเรียที่ใช้ออกซิเจนและไม่ใช้ออกซิเจนเพิ่มขึ้นในลำไส้เล็กของผู้ป่วยโรคไตวายเรื้อรังร่วมกับการเจริญเติบโตของลำไส้ใหญ่ของ Proteobacteria, Actinobacteria และ Firmicutes

โรคเบาหวาน CKD เป็นกระบวนการของโรคหลายระบบที่มีกระบวนการทางพยาธิสรีรวิทยาที่ซับซ้อน แท้จริงแล้วความสัมพันธ์ระหว่างสาเหตุและผลที่ตามมาระหว่างกระบวนการทางพยาธิวิทยาแบบไดนามิกและการเปลี่ยนแปลงที่เกี่ยวข้องกับจุลินทรีย์ในลำไส้นั้นยากที่จะแยกความแตกต่าง ปัจจัยที่ทราบกันดีว่ามีส่วนทำให้เกิด dysbiosis ใน CKD รวมถึงความสามารถในการซึมผ่านของสิ่งกีดขวางในลำไส้ที่เพิ่มขึ้นรองจากสภาพแวดล้อมที่มีการอักเสบและยูเรียมที่เกี่ยวข้องกับ CKD และการเคลื่อนย้ายของแบคทีเรียที่ทำให้เกิดโรคและ endotoxins ของแบคทีเรียจากเซลล์ลำไส้เข้าสู่กระแสเลือด เนื่องจากการซึมผ่านของลำไส้ที่เพิ่มขึ้นนี้ บุคคลส่วนใหญ่ที่เป็นโรคไตวายเรื้อรังที่เกี่ยวข้องกับโรคเบาหวานมักจะใช้ยาปฏิชีวนะในวงกว้างเนื่องจากความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นของการติดเชื้อที่เกิดจากภาวะนี้ การใช้ยาปฏิชีวนะดังกล่าวทำให้เกิดความไม่สมดุลระหว่าง Firmicutes และ Bacteroidetes ความหลากหลายของแบคทีเรียจะลดลงเช่นเดียวกับความอุดมสมบูรณ์ของแบคทีเรียเหล่านี้ในช่วงระยะเวลาการรักษาดังกล่าว นอกจากนี้ ตัวควบคุมที่สำคัญของเมแทบอลิซึมของแบคทีเรียและภาวะ dysbiosis ในลำไส้จะแสดงโดยความพร้อมและองค์ประกอบของสารอาหาร โดยเฉพาะอย่างยิ่งอัตราส่วนระหว่างคาร์โบไฮเดรตและโปรตีนที่ไม่ได้ย่อย ปัจจุบันมีกระบวนการที่เกี่ยวข้องกับ CKD หลายอย่างที่นำไปสู่การเกิด dysbiosis ในลำไส้ ตัวอย่างเช่น การดูดซึมโปรตีนในลำไส้เล็กบกพร่องใน CKD ทำให้ปริมาณโปรตีนในอาหารเพิ่มขึ้นในลำไส้ใหญ่ และเป็นผลให้อัตราส่วนคาร์โบไฮเดรตต่อโปรตีนในลำไส้ลดลง การเปลี่ยนแปลงในความพร้อมของสารตั้งต้นนี้อาจสนับสนุนการเปลี่ยนจาก saccharolytic ที่มีสุขภาพดี (สายพันธุ์ Bifidobacterium และ Lactobacillus) เป็นรูปแบบการหมักโปรตีนที่ทำให้เกิดโรคมากขึ้น แม้ว่ากลไกของการเกิด dysbiosis ในโรคเบาหวานจะไม่ค่อยเข้าใจอย่างชัดเจน แต่ก็แสดงให้เห็นว่าผู้ป่วยโรคเบาหวานโดยทั่วไปจะแสดงความหลากหลายของแบคทีเรียที่ลดลง โดยมีการลดลงของแบคทีเรียที่ผลิต butyrate เช่น Faecalibacterium prausnitzii และ Roseburia intestinalis พร้อมกับการเพิ่มขึ้นของเชื้อโรคฉวยโอกาส

ความสามารถในการแยกสาเหตุของโรคทางเดินอาหารผิดปกติเนื่องจากโรคไตวายเรื้อรังที่เกี่ยวข้องกับโรคเบาหวานเพียงอย่างเดียวยังคงเป็นความท้าทายทางคลินิกเนื่องจากมีโรคร่วมหลายอย่าง เช่น ความดันโลหิตสูง โรคอ้วน และโรคหลอดเลือด นอกจากนี้ กลยุทธ์การรักษาในผู้ป่วยเบาหวาน CKD รวมถึงยาและการจำกัดอาหาร ซึ่งตามที่อธิบายไว้ข้างต้น สามารถส่งผลต่อไมโครไบโอมในลำไส้ได้อย่างอิสระ แม้จะมีความซับซ้อนเหล่านี้ แต่ก็มีเหตุผลที่จะตั้งสมมติฐานว่าโรคไตและจุลินทรีย์ในลำไส้อาจมีอิทธิพลซึ่งกันและกัน

โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ความแตกต่างของไมโครไบโอมในลำไส้ระหว่างบุคคลที่มีสุขภาพดีและบุคคลที่เป็นเบาหวาน CKD ได้รับการบันทึกไว้แล้ว [16,23,46] เมื่อคำนึงถึงข้อมูลเหล่านี้ เราจึงทำการวิเคราะห์แบบภาคตัดขวางของโปรไฟล์ DNA ในตัวอย่างอุจจาระ 95 ตัวอย่างจากประชากรออสเตรเลียที่เป็นเบาหวานชนิดที่ 2 ซึ่งมีระยะต่างๆ กัน (1-5) ของ CKD เพื่อตอบคำถามว่าไมโครไบโอมในลำไส้มีการเปลี่ยนแปลงหรือไม่ ระยะต่างๆ ของเบาหวาน CKD เหล่านี้ ด้วยเหตุนี้ จุดสิ้นสุดหลักคือการระบุโปรไฟล์ไมโครไบโอมที่แตกต่างกันที่เป็นไปได้ระหว่างกลุ่มที่มี CKD ในระยะแรกและช่วงปลาย พื้นฐานสำหรับการตัด CKD ระยะ 1, 2 และ 3a ออกเป็นกลุ่มแรกและ CKD ระยะ 3b, 4 และ 5 ในกลุ่มท้าย เนื่องจากความเสี่ยงของการเกิดภาวะไตวายเรื้อรังและโรคหัวใจและหลอดเลือดเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญตั้งแต่ CKD ระยะ 3b เป็นต้นไป และการแทรกแซงทางคลินิกซึ่งมีจุดมุ่งหมายเพื่อชะลอการลุกลามของโรคไตวายเรื้อรังมีความสำคัญเป็นพิเศษ

ข้อมูลแสดงให้เห็นว่า microbiome ในลำไส้ของบุคคลที่เป็นเบาหวานระยะแรกและระยะปลายและระยะ 1-5 ของเบาหวาน CKD นั้นคล้ายคลึงกัน สอดคล้องกับวรรณกรรม เราได้แสดงให้เห็นว่ามีความเด่นของไฟลัม Firmicutes และ Bacteroidetes ในกลุ่มของเรา (รูปที่ 4A) ในการศึกษาของเรา เราได้แสดงให้เห็นอย่างชัดเจนว่าสกุลที่เกี่ยวข้องในทางลบกับโรคเบาหวานประเภท 2 ซึ่งทำให้เกิด dysbiosis โดยเฉพาะ Faecalibacterium, Bifidobacterium, Bacteroides และ Akkermansia มีอยู่ตลอดระยะของ CKD ในปริมาณที่ใกล้เคียงกัน (รูปที่ 5A-D) สกุล Ruminococcus ที่เกี่ยวข้องในเชิงบวกในผู้ป่วยเบาหวานชนิดที่ 2 ยังแสดงความแตกต่างที่มีนัยสำคัญในความชุกชุมสัมพัทธ์ของมันใน CKD เบาหวานระยะเริ่มต้นหรือระยะสุดท้าย (รูปที่ 5A) แบคทีเรียที่สลายโปรตีน phyla Actinobacteria และ Firmicutes ซึ่งแสดงให้เห็นว่าส่งผลให้เกิดการเจริญของลำไส้มากเกินไป มีอยู่ตลอดระยะของ CKD ในจำนวนที่ใกล้เคียงกัน (รูปที่ 6A) นอกจากนี้ เมื่อเราตรวจสอบความหลากหลายทางนิเวศวิทยาภายในตัวอย่างจุลินทรีย์ของแต่ละระยะของ CKD ที่เป็นเบาหวานและเปรียบเทียบกับแต่ละระยะของ CKD ที่เป็นเบาหวานอื่นๆ เรายังไม่สังเกตเห็นความแตกต่างที่มีนัยสำคัญ (รูปที่ 3B) การค้นพบนี้ยืนยันหลักฐานที่ทราบเกี่ยวกับ dysbiosis ในสถานะของโรค แต่ยังให้หลักฐานใหม่ที่แสดงให้เห็นว่า dysbiosis ของลำไส้ที่ได้มาใน CKD เบาหวานระยะเริ่มต้นยังคงเสถียรและคงอยู่จนถึงระยะต่อมาของการลุกลามของโรค ข้อมูลเหล่านี้สร้างขึ้นจากวรรณกรรมที่มีอยู่ซึ่งมีการตรวจสอบองค์ประกอบของจุลินทรีย์ในทางเดินอาหารในกลุ่ม CKD สองกลุ่ม Kai-Yu Xu และคณะ ตรวจสอบไมโครไบโอมในลำไส้ในผู้ป่วย 15 รายในกลุ่มย่อย GFR สูง ซึ่งกำหนดเป็น GFR มากกว่าหรือเท่ากับ 7 มล./นาที/1.73 ตร.ม. และกลุ่มย่อย GFR ต่ำ ซึ่งกำหนดเป็น GFR น้อยกว่าหรือเท่ากับ 7 มล./นาที/1.73 ตร.ม. . แม้ว่าจะสอดคล้องกับข้อมูลของเรา แต่ก็ยากที่จะสรุปผลมากเกินไปจากการศึกษา เนื่องจากมีจำนวนน้อยภายในกลุ่มย่อยและการใช้ GFR cut-offs ที่ไม่สะท้อนสเปกตรัมทางคลินิกของระยะต่างๆ ของโรคไตเรื้อรังเนื่องจากทั้งสองกลุ่มย่อยอยู่ในขั้นที่ 5 หรือขั้นสุดท้ายโรคไต

ข้อมูลของเราแสดงให้เห็นว่าจำนวนสัมพัทธ์เฉลี่ยของแบคทีเรียไฟลาและครอบครัวในระยะที่ 1-5 ของโรคไตวายเรื้อรังส่วนใหญ่มีความคล้ายคลึงกัน (รูปที่ 4A, B) ข้อมูลนี้สอดคล้องกับข้อมูลที่เกิดจากการศึกษาของ Yacoub และคณะ ซึ่งประเมินไมโครไบโอมในลำไส้ของบุคคลที่มีถุงน้ำหลายใบโรคไตด้วยระยะต่างๆ ของ CKD Yacoub et al. ทำการศึกษาในกลุ่มบุคคลที่มีถุงน้ำหลายใบเท่านั้นโรคไตและกลุ่มโรคไตวายเรื้อรัง 3 กลุ่มที่ไม่มีโรคร่วมของโรคเบาหวานและความดันโลหิตสูงเพื่อตรวจสอบผลของระดับความไม่เพียงพอของไตที่แตกต่างกันต่อไมโครไบโอมในลำไส้ของมนุษย์ แม้จะมีผู้ป่วยจำนวนน้อยหกรายในแต่ละกลุ่ม CKD 3 กลุ่ม พวกเขาไม่ได้แสดงให้เห็นถึงความแตกต่างในหน่วยอนุกรมวิธานปฏิบัติการ (OTUs) ที่ระดับไฟลาใน 3 กลุ่มที่มีความผิดปกติของไตที่แตกต่างกัน

ไมโครไบโอมในลำไส้ที่แตกต่างกันซึ่งมีตระกูล Prevotellaceae ที่ลดลงมีความสัมพันธ์กับ CKD สอดคล้องกับเอกสารฉบับนี้ ผลลัพธ์ของเราได้แสดงให้เห็นเพิ่มเติมถึงความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ต่ำของ Prevotellaceae ที่เป็นประโยชน์ทั้งในระยะเริ่มต้น (3.87 ± 1.66 เปอร์เซ็นต์) และช่วงปลาย (3.36 ± 0.98 เปอร์เซ็นต์) ของระยะเบาหวาน CKD (รูปที่ 6B) . สายพันธุ์ Prevotella ได้รับการพิจารณาแบบคลาสสิกว่าเป็นแบคทีเรียร่วมเพศเนื่องจากมีอยู่มากมายในร่างกายมนุษย์ที่มีสุขภาพดี Prevotella เป็นสกุลที่มีความหลากหลายทางพันธุกรรมสูงทั้งภายในและระหว่างสปีชีส์ ซึ่งสามารถอธิบายถึงความอุดมสมบูรณ์ของมันในจุลินทรีย์ที่ดีต่อสุขภาพของมนุษย์ ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ แบคทีเรียที่อยู่ร่วมกันเหล่านี้ผลิตกรดไขมันสายสั้น (SCFAs) โดยเฉพาะอย่างยิ่งกรดบิวทีริก ซึ่งมีความสำคัญต่อการรักษาสุขภาพของลำไส้ บทบาทของ SCFAs รวมถึงแต่ไม่จำกัดเพียงการผลิตสารอาหารเยื่อบุผิวในลำไส้และส่วนประกอบพลังงาน รักษาการทำงานของสิ่งกีดขวางในลำไส้ และลดความรุนแรงของการอักเสบ เช่นเดียวกับการศึกษาของเรา Vaziri et al. พบความชุกชุมลดลงของสัตว์ตระกูล Prevotellaceae ในสัตว์ตระกูลยูเรมิค

ในการศึกษาของเรา ไม่มีความแตกต่างที่พิสูจน์ได้ในหน่วยอนุกรมวิธานปฏิบัติการ (OTUs) ที่ระดับอนุกรมวิธานใด ๆ ในทุกระยะของโรคไตวายเรื้อรังที่เป็นเบาหวาน ซึ่งบ่งชี้ว่า dysbiosis ปรากฏขึ้นในช่วงต้นของโรคไตวายเรื้อรังที่เป็นเบาหวานและคงอยู่จนถึงระยะท้าย ๆ ของโรค ดังนั้นการเพิ่ม คำถามที่ว่า dysbiosis ของลำไส้มีบทบาทอย่างไรในการลุกลามของโรค CKD ที่เป็นเบาหวาน เราตั้งสมมติฐานว่า dysbiosis เป็นหนึ่งในหลายปัจจัยที่อาจส่งผลต่อการลุกลามของโรค CKD ที่เป็นเบาหวาน ภาวะโรคร่วม เช่น ความดันโลหิตสูง เบาหวาน และโรคหลอดเลือด รวมทั้งโปรตีนในปัสสาวะและพันธุกรรมเป็นปัจจัยส่วนหนึ่งที่ทำให้เกิดโรคของโรคไตเรื้อรัง. เมื่อเร็ว ๆ นี้ มีหลักฐานเพิ่มมากขึ้นว่าการทำงานร่วมกันของยีนกับสิ่งแวดล้อมในการกำหนดฟีโนไทป์ที่ซับซ้อน หรือที่เรียกว่าอีพิเจเนติกส์ ยังเป็นสาเหตุของการเกิดโรคของโรคไตเรื้อรัง.เราตั้งสมมติฐานว่า dysbiosis ของลำไส้คล้ายกับปัจจัยเสี่ยงที่แตกต่างกันข้างต้น อาจให้ปัจจัยเสี่ยงที่อาจเกิดขึ้นในการลุกลามของโรคไตวายเรื้อรัง

เป็นที่ทราบกันดีว่าในภาวะ dysbiosis ของลำไส้ แบคทีเรียที่ทำให้เกิดโรคจะเติบโตมากเกินไปและหลั่ง lipopolysaccharides, peptidoglycans และ DNA ของแบคทีเรียในปริมาณที่เพิ่มขึ้นเข้าสู่ระบบไหลเวียนโลหิตของโฮสต์ซึ่งเป็นอันตรายต่อการซึมผ่านของลำไส้ ส่งผลให้เกิดการกระตุ้นระบบภูมิคุ้มกันของเยื่อบุลำไส้และการอักเสบด้วยการสร้างปัจจัยต่างๆ เช่น อินเตอร์ลิวคิน (IL)-6, อินเตอร์ฟีรอน (IFN-) และปัจจัยเนื้อร้ายของเนื้องอก (TNF) การกระตุ้นภูมิคุ้มกันแบบถาวรดังกล่าวถือเป็นปัจจัยเสี่ยงที่สำคัญสำหรับความก้าวหน้าของโรคไตวายเรื้อรังและภาวะแทรกซ้อนของหลอดเลือดหัวใจ ผลกระทบของ dysbiosis ในลำไส้ต่อการผลิตปัจจัยการอักเสบในโรคไตวายเรื้อรังถูกสอบสวนโดย Li F และคณะ . และผลลัพธ์ของพวกเขาชี้ให้เห็นว่า microbiota dysbiosis อาจส่งเสริมการอักเสบเรื้อรังของระบบในโรคไตวายเรื้อรัง

โรคเบาหวานเกิดขึ้นบ่อยมากและมีอยู่ทั่วโลกในสัดส่วนการแพร่ระบาดในขณะที่โรคเบาหวานโรคไตเรื้อรังเป็นผลสืบเนื่องทั่วไป อย่างไรก็ตาม มีเพียงส่วนน้อยของบุคคลเหล่านี้ที่มีโรคไตวายเรื้อรังความคืบหน้าในการโรคไตระยะสุดท้าย (ESKD)ตลอดชีวิตของพวกเขา เราตั้งสมมติฐานว่าปัจจัยเสี่ยงแบบดั้งเดิมแต่ละอย่างอาจเกี่ยวข้องกับการพัฒนาของโรคไตวายเรื้อรัง อย่างไรก็ตาม ลักษณะที่ก้าวหน้าของโรคนี้ซึ่งเกิดขึ้นในส่วนน้อยของทุกคนที่มีอาการ อาจเป็นผลมาจากปฏิสัมพันธ์ที่ซับซ้อนของปัจจัยเสี่ยงเหล่านี้ทั้งหมด รวมถึง dysbiosis ของลำไส้ (วัสดุเสริมรูปที่ S1)

หนึ่งในข้อจำกัดของการศึกษานี้คือขนาดตัวอย่างที่เล็ก โดยเฉพาะอย่างยิ่งการมีผู้ป่วยเพียง 25 รายที่เป็นเบาหวานระยะสุดท้าย (3b–5) CKD ส่งผลให้สูญเสียความสามารถในการรับรู้แนวโน้มของจุลินทรีย์ เหตุผลประการหนึ่งคืออาสาสมัครที่ทำการศึกษาได้รับการคัดเลือกจากคลินิกต่อมไร้ท่อสำหรับผู้ป่วยนอก ซึ่งมีแนวโน้มที่จะเห็นความผิดปกติของไตขั้นสูงน้อยกว่า เรารับทราบว่าปัญหาโดยธรรมชาติของตัวอย่างขนาดเล็กในกลุ่ม CKD ระยะหลังพร้อมกับตัวแปรร่วมจำนวนมากของเราจะส่งผลให้พลังทางสถิติที่จำกัดในการตรวจจับความแตกต่างของไมโครไบโอม ตลอดจนความไม่แม่นยำของการประมาณผลกระทบและอัตราการบวกเท็จที่สูงขึ้น ข้อจำกัดอื่นๆ ได้แก่ ลักษณะภาคตัดขวางของกลุ่มการศึกษานี้ ซึ่งหมายความว่าตัวอย่างผู้ป่วยถูกเก็บที่จุดเพียงครั้งเดียวและไม่ได้ศึกษาตามยาว นอกจากนี้ ชุดข้อมูลของเราไม่มีข้อมูลเกี่ยวกับการใช้ยาปฏิชีวนะ ซึ่งทราบกันดีว่ามีผลกระทบต่อองค์ประกอบของไมโครไบโอมในลำไส้ ข้อจำกัดที่สำคัญอีกประการหนึ่งคือ พฤติกรรมการบริโภคอาหารของผู้เข้าร่วมไม่ได้รับการบันทึก ซึ่งจะส่งผลต่อผลลัพธ์อย่างสม่ำเสมอ นอกจากนี้ยังไม่มีกลุ่มที่มีสุขภาพดี อย่างไรก็ตาม ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ไมโครไบโอมระหว่างกลุ่มที่มีสุขภาพดีและกลุ่มที่เป็นโรคมีลักษณะเฉพาะที่ดีและไม่ใช่จุดประสงค์ของการศึกษานี้

ทิศทางในอนาคตของการวิจัยในสาขานี้ควรรวมถึงการศึกษาระยะยาวของผู้ป่วยจำนวนมากขึ้นในแต่ละระยะของโรคเบาหวานประเภท CKD (1-5) โดยเน้นที่รูปแบบเด่นของโรคเบาหวานประเภท 2 โดยมีข้อมูลรวมถึงการบริโภคอาหารและ ยาโดยเฉพาะเกี่ยวกับการใช้ยาปฏิชีวนะ

การศึกษานี้ทำให้เกิดคำถามที่ไม่คาดคิดและน่าสนใจเกี่ยวกับไมโครไบโอมในผู้ป่วยเบาหวานและแตกต่างกันไตทำงานผิดปกติ. เรารู้จากเอกสารปัจจุบันว่ามีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในไมโครไบโอมในลำไส้ระหว่างคนที่มีสุขภาพดีและคนที่เป็นเบาหวาน CKD อย่างไรก็ตาม ภายใต้ข้อจำกัดของการศึกษานี้ เราไม่ได้สังเกตเห็นการเปลี่ยนแปลงที่มีนัยสำคัญในไมโครไบโอมใน 6 ขั้นตอนใดๆ ของโรคเบาหวาน CKD เราเสนอว่าเมื่อผู้ป่วยบรรลุภาวะ dysbiosis ใน CKD ที่เป็นเบาหวานระยะแรกแล้ว ภาวะ dysbiosis นี้ยังคงค่อนข้างเหมือนเดิมและอาจถือเป็นปัจจัยเสี่ยงที่อ่อนแอ ซึ่งร่วมกับปัจจัยเสี่ยงอื่นๆ (แบบดั้งเดิมและแบบใหม่) มีอิทธิพลต่อการลุกลามไปสู่การเป็นโรคเบาหวานระยะสุดท้าย โรคไตวายเรื้อรัง

5. สรุปผลการวิจัย

โดยสรุป ข้อมูลที่เกิดจากกลุ่มคนที่เป็นโรคเบาหวานที่เกี่ยวข้องกับโรคไตวายเรื้อรังของเราแสดงให้เห็นความเด่นของไฟลา Firmicutes และ Bacteroidetes ตระกูล Ruminococcaceae และ Bacteroidaceae แสดงถึงความอุดมสมบูรณ์สูงสุด ในขณะที่ตระกูล Prevotellaceae ที่เป็นประโยชน์นั้นมีความอุดมสมบูรณ์ลดลง ข้อสังเกตที่น่าสนใจที่สุดคือปริมาณสัมพัทธ์ของจุลินทรีย์ในลำไส้เหล่านี้ไม่เปลี่ยนแปลงตลอดระยะ (1–5) ของโรคไตวายเรื้อรัง ซึ่งบ่งชี้ว่านี่เป็นเหตุการณ์แรกเริ่มในการพัฒนาของโรคไตวายเรื้อรังที่เกี่ยวข้องกับโรคเบาหวาน สกุล Bifidobacterium, Bacteroides, Faecalibacterium และ Akkermansia ที่เกี่ยวข้องในเชิงลบเกี่ยวกับโรคเบาหวานประเภท 2 แสดงให้เห็นความอุดมสมบูรณ์ที่คล้ายคลึงกันระหว่างกลุ่ม CKD ในช่วงต้นและปลายเช่นเดียวกับ Ruminococcus ที่เกี่ยวข้องในเชิงบวก เราตั้งสมมติฐานว่า microbiome dysbiotic ที่ได้รับในช่วงแรกของโรคเบาหวาน CKD ยังคงค่อนข้างคงที่และเป็นเพียงหนึ่งในปัจจัยเสี่ยงหลายอย่างที่มีอิทธิพลต่อความก้าวหน้าไตทำงานผิดปกติ. การค้นพบนี้รับประกันการตรวจสอบเพิ่มเติมในกลุ่มผู้ป่วยที่ใหญ่ขึ้นตามยาวเมื่อเวลาผ่านไปด้วยการสุ่มตัวอย่างหลายครั้งและข้อมูลทางคลินิกรวมถึงข้อมูลเกี่ยวกับการบริโภคอาหารและยา จากนั้นจึงจะสามารถทดสอบได้อย่างแน่ชัดว่าองค์ประกอบไมโครไบโอติกของ dysbiotic ยังคงเหมือนเดิมหรือเปลี่ยนแปลงอย่างมีนัยสำคัญตามความก้าวหน้าของโรคเบาหวานเรื้อรังหรือไม่โรคไต?

เงินทุน:งานวิจัยนี้ไม่ได้รับเงินทุนสนับสนุนจากภายนอก

คำชี้แจงความยินยอมที่ได้รับการบอกกล่าว:ได้รับความยินยอมจากทุกวิชาที่เกี่ยวข้องในการศึกษา

กิตติกรรมประกาศ:ผู้เขียนขอขอบคุณ Kyoko Hasebe ที่ช่วยเหลือในการสกัดดีเอ็นเอและการตรวจสอบโปรโตคอล ผู้เขียนรับทราบผู้เข้าร่วมที่ได้สละเวลาในการศึกษาวิจัยอย่างเอื้อเฟื้อเผื่อแผ่

ผลประโยชน์ทับซ้อน:ผู้เขียนประกาศว่าไม่มีความขัดแย้งทางผลประโยชน์

1. ฮูเปอร์ แอล.วี.; Gordon, JI Commensal ความสัมพันธ์ระหว่างโฮสต์กับแบคทีเรียในลำไส้ วิทยาศาสตร์ 2544, 292, 1115–1118

2. บูร์ลิอูซ์ พี.; Koletzko, บี; การ์เนอร์ เอฟ; Braesco, V. ลำไส้และจุลินทรีย์เป็นหุ้นส่วนในการปกป้องโฮสต์: รายงานการประชุม Danone Symposium "The Intelligent Intestine" ซึ่งจัดขึ้นที่ปารีส 14 มิถุนายน 2545 น. เจ. คลิน. นัท 2546, 78, 675–683.

3. โรดริเกซ เจเอ็ม; เมอร์ฟี่, เค; สแตนตัน ซี; รอสส์ อาร์พี; โคเบอร์, OI; Juge, น.; Avershina, E.; ฤดี, พ.; นาร์บัด, อ.; เจนมาล์ม หม่อมเจ้า ; และอื่น ๆ องค์ประกอบของจุลินทรีย์ในลำไส้ตลอดชีวิต โดยเน้นตั้งแต่อายุยังน้อย จุลินทรีย์ อีคอล. รักษา. โรค 2558, 26, 26050.

4. อารอน-วิสนิวสกี้ เจ; Clément, K. ไมโครไบโอมในลำไส้ อาหาร และการเชื่อมโยงไปยังความผิดปกติของระบบหัวใจและหลอดเลือดและโรคเรื้อรัง ณัฐ. รายได้ Nephrol 2015, 12, 169–181.

5. ฮัทเทนฮาวร์ ซี; เกเวอร์ส, ด.; อัศวิน ร.; Abubucker, S.; แบดเจอร์, JH; ชินวัลลา, แอต. ; เครซี่, ฮ.; เอิร์ล AM; ฟิตซ์เจอรัลด์, มก.; ฟุลตัน อาร์เอส ; และอื่น ๆ โครงสร้าง หน้าที่ และความหลากหลายของไมโครไบโอมของมนุษย์ที่มีสุขภาพดี ธรรมชาติ 2012, 486, 207–214.

6. เลย์, เร; เทิร์นโบห์ พีเจ ; ไคลน์ เอส; Gordon, JI จุลินทรีย์ในลำไส้ของมนุษย์ที่เกี่ยวข้องกับโรคอ้วน ธรรมชาติ 2549, 444, 1022–1023

7. คาร์ลสสัน เอฟเอช; Tremaroli, V.; หนูแก้ว, I.; เบิร์กสตรอม, G.; แบร์, CJ; Fagerberg, บี; Nielsen, J. Gut metagenome ในสตรีชาวยุโรปที่มีการควบคุมระดับน้ำตาลปกติ บกพร่อง และเบาหวาน ธรรมชาติ 2013, 498, 99–103.

8. สมาพันธ์เบาหวานนานาชาติ (IDF) Diabetes Atlas, 7th ed.; สมาพันธ์เบาหวานนานาชาติ: บรัสเซลส์ เบลเยียม 2558

9. US Renal Data System 2008. รายงานข้อมูลประจำปี. Atlas of Chronic Kidney Disease and End Stage Renal Disease in the United States; สถาบันสุขภาพแห่งชาติ, สถาบันเบาหวานและทางเดินอาหารและไตแห่งชาติ: Bethesda, MD, USA, 2008

10. วัลมาดริด, คอนเนตทิคัต; ไคลน์ อาร์; มอสส์, เสริฐ; Klein, BE ความเสี่ยงของการเสียชีวิตด้วยโรคหัวใจและหลอดเลือดที่เกี่ยวข้องกับไมโครอัลบูมินยูเรียและโปรตีนในปัสสาวะรวมในผู้ที่เป็นเบาหวานที่มีอายุมาก โค้ง. นักศึกษาฝึกงาน แพทย์ พ.ศ. 2543, 160, 1093–1100

11. คาร์เรโร, เจเจ; Stenvinkel, P. การอักเสบอย่างต่อเนื่องเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาสำหรับปัจจัยเสี่ยงอื่น ๆ ในโรคไตเรื้อรัง: ข้อเสนอสมมติฐาน คลิน. แยม. สังคม เนฟรอล 2552, 4 (ภาคผนวก 1), S49–S55.

12. เสน เอ็น.; โวเจนเซ่น, เอฟเค ; ฟาน เดน เบิร์ก, FWJ; นีลเส็น ดีเอส; แอนเดรียส เอเอส ; Pedersen บีเค ; Abu Al-Soud, W.; เซอเรนเซน เอสเจ ; แฮนเซน แอลเอช ; Jakobsen, M. Gut Microbiota ในผู้ใหญ่ที่เป็นเบาหวานชนิดที่ 2 แตกต่างจากผู้ใหญ่ที่ไม่เป็นเบาหวาน กรุณาหนึ่ง 2010, 5, e9085.

13. ฉิน เจ; ลี่, วาย.; ไค, ซี; หลี่ เอส; จู้ เจ; จาง ฉ.; เหลียง เอส; จาง ดับเบิลยู; กวน, ย.; เซิน, ด.; และอื่น ๆ การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งเมตาจีโนมของจุลินทรีย์ในลำไส้ในผู้ป่วยเบาหวานชนิดที่ 2 ธรรมชาติ 2012, 490, 55–60.

14. ฟัก ม.; ฟรีล, RW; Vaziri, ND การขับออกซาเลตในลำไส้ในภาวะไตวายเรื้อรัง แยม. สังคม เนฟรอล พ.ศ. 2537, 5, 1339–1343.

15. วาซิรี นอร์ทดาโคตา; ฟรีล, RW; Hatch, M. ผลของภาวะไตวายเรื้อรังต่อเมแทบอลิซึมของเกลือยูเรต แยม. สังคม เนฟรอล 2538, 6, 1313–1317.

16. Xu, K.-Y.; เซี่ย, G.-H.; ลู, J.-Q.; เฉิน, M.-X.; เจิ้น, X.; วัง ส.; คุณ ซี; Nie, J.; โจว เอช; Yin, J. การทำงานของไตบกพร่องและ dysbiosis ของ microbiota ในลำไส้มีส่วนทำให้ trimethylamine-N-oxide เพิ่มขึ้นในผู้ป่วยโรคไตเรื้อรัง วิทย์ ตัวแทน 2017, 7, 1–12.

17. ยาคูบ อาร์; นูเจนต์ ม.; ไค, ดับบลิว; นัดการ์นี GN; ชาเวส แอลดี; อบียาด เอส.; ฮอนัน, AM; โทมัส สานัก; เจิ้ง ว.; วาลิยา ปารัมบิล, SA; และอื่น ๆ ผลิตภัณฑ์ขั้นสุดท้ายไกลเคชั่นขั้นสูงมีผลต่อการจำกัดอาหารต่อจุลินทรีย์ในลำไส้ของแบคทีเรียในผู้ป่วยล้างไตทางช่องท้อง; การทดลองแบบสุ่มที่มีการควบคุมแบบเปิดฉลาก กรุณาหนึ่ง 2017, 12, e0184789

18. ซาบาติโน่ อ.; Regolisti, G.; โคโซลา ซี; Gesualdo, L.; Fiaccadori, E. จุลินทรีย์ในลำไส้ในผู้ป่วยเบาหวานชนิดที่ 2 และโรคไตเรื้อรัง สกุลเงิน ตัวแทนโรคเบาหวาน 2017, 17, 16

19. เฟลิซาร์โด อาร์เจเอฟ; คาสตอลดี, อ.; Andrade-Oliveira, V.; Câmara, NOS จุลินทรีย์และโรคไตเรื้อรัง: ดาบสองคม คลิน. แปล อิมมูนอล 2016, 5, จ86. 20. หว่อง เจ; พิเชโน วายเอ็ม ; เดอซานติส, TZ; ปาห์ล ม.; แอนเดอร์เซ็น จีแอล; Vaziri, ND การขยายตัวของการสร้าง indole และ p-cresol ที่มียูรีเอสและ uricase และการหดตัวของ microbiota ในลำไส้ที่สร้างกรดไขมันสายสั้นใน ESRD เช้า. เจ. เนฟรอล. 2557, 39, 230–237.

21. เลอ ชาเตลิเยร์, E.; นีลเส็น ที.; ฉิน เจ; พริฟตี, อี.; ฮิลเดอร์บรันด์, เอฟ.; Falony, G.; อัลมีดา ม.; Arumugam, M.; Batto, J.-M.; เคนเนดี เอส; และอื่น ๆ ความสมบูรณ์ของไมโครไบโอมในลำไส้ของมนุษย์มีความสัมพันธ์กับเครื่องหมายเมตาบอลิซึม ธรรมชาติ 2013, 500, 541–546.

22. เดอ อันดราเด, ลอสแอนเจลิส; รามอส, ซีไอ ; Cuppari, L. การพูดคุยข้ามระหว่างไตและลำไส้: ผลกระทบของโรคไตเรื้อรัง นูทริเร่ 2017, 42, 27.

23. วาซิรี นอร์ทดาโคตา; หว่อง เจ; ปาห์ล, เอ็มวี; พิเชโน วายเอ็ม ; หยวนเจ; เดอซานติส, TZ; Ni, Z.; Nguyen, T.-H.; Andersen, GL โรคไตเรื้อรังทำให้จุลินทรีย์ในลำไส้เปลี่ยนแปลง โรคไต 2556, 83, 308–315.

24. มาร์ติเนซ-กัสเตเลา เอ; นาวาร์โร-กอนซาเลซ เจเอฟ ; กอร์ริซ, เจแอล ; de Alvaro, F. แนวคิดและระบาดวิทยาของโรคไตจากเบาหวานมีการเปลี่ยนแปลงในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมา เจ. คลิน. แพทย์ 2015, 4, 1207–1216.

25. มูลนิธิ NK ACR.

26. ไป AS; เชอร์โทว์ จีเอ็ม; แฟน, ง.; แมคคัลล็อก, CE; Hsu, C.-Y. โรคไตเรื้อรังและความเสี่ยงของการเสียชีวิต เหตุการณ์เกี่ยวกับหัวใจและหลอดเลือด และการรักษาตัวในโรงพยาบาล เอ็น อังกฤษ เจ เมด 2547, 351, 1296–1305.

27. จาง เจ; โคเบิร์ต เค; แป้ง, ท.; Stamatakis, A. PEAR: Illumina Paired-End reAd mergeR ที่รวดเร็วและแม่นยำ ชีวสารสนเทศ 2014, 30, 614–620.

28. คาโปรราโซ เจจี; คูซินสกี้ เจ; Stombaugh, เจ; Bittinger, เค; บุชแมน FD ; คอสเตลโล, เอก; Fierer, N.; Peña, เอจี; กู๊ดริช, เจ.เค.; กอร์ดอน เจไอ ; และอื่น ๆ QIIME ช่วยให้สามารถวิเคราะห์ข้อมูลการจัดลำดับชุมชนปริมาณงานสูงได้ ณัฐ. วิธีการ 2010, 7, 335–336

29. Edgar, RC Search และการจัดกลุ่มลำดับความสำคัญเร็วกว่า BLAST ชีวสารสนเทศ 2553, 26, 2460–2461.

30. เอ็ดการ์ อาร์ซี; ฮาส บีเจ ; เคลเมนเต้ เจ.ซี. ; ควินซ์ ซี; Knight, R. UCHIME ปรับปรุงความไวและความเร็วของการตรวจจับความฝัน ชีวสารสนเทศ 2554, 27, 2194–2200.

31. Edgar, RC UPARSE: ลำดับ OTU ที่แม่นยำสูงจากการอ่าน amplicon ของจุลินทรีย์ ณัฐ. วิธีการ 2013, 10, 996–998

32. DeSantis, นิวซีแลนด์; Hugenholtz, P.; เสน, N.; โรจา, ม.; โบรดี้, เอล; เคลเลอร์ เค; ฮูเบอร์ ต.; Dalevi, D.; หู, พี; Andersen, GL Greengenes, ฐานข้อมูลยีน 16S rRNA ที่ตรวจสอบโดยไคเมร่า และโต๊ะทำงานที่เข้ากันได้กับ ARB แอป สิ่งแวดล้อม. ไมโครไบโอล. 2549, 72, 5069–5072.

33. แมคเมอร์ดี, พีเจ; Holmes, S. phyloseq: แพ็คเกจ R สำหรับการวิเคราะห์เชิงโต้ตอบที่ทำซ้ำได้และกราฟิกของข้อมูลสำมะโนไมโครไบโอม กรุณาหนึ่ง 2013, 8, e61217.

34. แชนนอน, CE ทฤษฎีทางคณิตศาสตร์ของการสื่อสาร ระบบเบลล์ เทคโนโลยี ญ. 1948, 27, 379–423.

35. Bauer, DF การสร้างชุดความเชื่อมั่นโดยใช้สถิติอันดับ แยม. สถิติ รศ. 2515, 67, 687.

36. โลซูโปน ซี; Knight, R. UniFrac: วิธีการทางสายวิวัฒนาการใหม่สำหรับการเปรียบเทียบชุมชนจุลินทรีย์ แอป สิ่งแวดล้อม. ไมโครไบโอล. 2548, 71, 8228–8235.

37. โลซูโปน ซี; ลาดเซอร์, เมน; อัศวิน, D.; Stombaugh, เจ; Knight, R. UniFrac: เมตริกระยะทางที่มีประสิทธิภาพสำหรับการเปรียบเทียบชุมชนจุลินทรีย์ ISME J. 2011, 5, 169–172.

38. อ็อกซาเน็น เจ; Kindt, อาร์; เลเจนเดร, พี; โอฮาร่า บี; ซิมป์สัน, จีแอล; โซลีมอส พี; สตีเวนส์ MHH; Eduard Szoecs, E.; Wagner, H. Vegan: แพ็คเกจนิเวศวิทยาชุมชน แพ็กเกจ R เวอร์ชัน 1.13-12 2551.

39. กูรุง ม.; หลี่, ซี; คุณ H.; โรดริเกซ อาร์; กระโดด, ฐานข้อมูล; มอร์แกน อ.; Shulzhenko, N. บทบาทของจุลินทรีย์ในลำไส้ในพยาธิสรีรวิทยาของเบาหวานชนิดที่ 2 EBioMedicine 2020, 51, 102590

40. เซอร์คานา, อ.; Framarin, L.; ลีโอน เอ็น; เบอร์รุตติ ม.; Castellino, F.; Parente, ร.; เด มิเคียลี เอฟ; Paschetta, อี.; Musso, G. เปลี่ยนแปลง Gut Microbiota ในโรคเบาหวานประเภท 2: เป็นเรื่องบังเอิญ? สกุลเงิน ตัวแทนโรคเบาหวาน 2018, 18, 98.

41. วาซิรี นอร์ทดาโคตา; หยวนเจ; Nazertehrani, S.; Ni, Z.; Liu, S. โรคไตเรื้อรังทำให้เกิดการหยุดชะงักของกระเพาะอาหารและลำไส้เล็กส่วนแยกเยื่อบุผิวแน่น เช้า. เจ. เนฟรอล. 2556, 38, 99–103.

42. รินนินเนลลา, อี.; ราอูล พี; ซินโทนี ม.; ฟรานเชสกี้ เอฟ; มิกจิอาโน, กาด; กัสบารินี, อ.; Mele, MC องค์ประกอบของจุลินทรีย์ในลำไส้ที่ดีต่อสุขภาพคืออะไร? ระบบนิเวศที่เปลี่ยนแปลงไปตามอายุ สิ่งแวดล้อม อาหาร และโรคต่างๆ จุลินทรีย์ 2019, 7, 14.

43. แบมเมนส์, บี; Verbeke, K.; Vanrentergem, Y.; Evenepoel, P. หลักฐานการดูดซึมโปรตีนบกพร่องในภาวะไตวายเรื้อรัง โรคไต 2546, 64, 2196–2203.

44. โมราเอส ซี; ฟูเก้, ด.; อมาราล, เอซี ; Mafra, D. Trimethylamine N-Oxide จาก Gut Microbiota ในผู้ป่วยโรคไตเรื้อรัง: มุ่งเน้นไปที่อาหาร เจ เรน นัท 2558, 25, 459–465.

45. มอนเตมูร์โน, อี.; โคโซลา ซี; ดัลฟิฟิโน จี; ไดโดน จี; เดอ แองเจลิส, ม.; Gobbetti, ม.; Gesualdo, L. คุณอยากกินอะไร คุณ CKD Microbiota? อาหารเมดิเตอร์เรเนียน โปรด! ไตโลหิตกด. ความละเอียด 2014, 39, 114–123.

46. ​​Gradisteanu, G.; สโตอิกา อาร์.; เพ็ตคู, ล.; พิคู, อ.; สุเชเวณู อ.; ซัลเมน, ที.; สเตฟาน, ด.; เซราฟิฟินเซอานู, ซี; ชิฟิริอุค เอ็มซี ; Stoian, AP Microbiota ลงนามในผู้ป่วยเบาหวานประเภท-2 ที่เป็นโรคไตเรื้อรัง—การศึกษานำร่อง เจมายด์เมดวิทย์. 2019, 6, 130–136.

47. หลี่ ฉ.; วัง ม.; วังเจ; หลี่ อาร์; Zhang, Y. การเปลี่ยนแปลงของจุลินทรีย์ในลำไส้และความสัมพันธ์กับปัจจัยการอักเสบในโรคไตเรื้อรัง ด้านหน้า. เซลล์ ติดเชื้อ ไมโครไบโอล. 2019, 9, 206.

48. ยาคูบ ร.; นัดการ์นี GN; แมคสกิมมิ่ง ดิไอ; ชาเวส แอลดี; อบียาด เอส.; บรีเนียร์สกี้, แมสซาชูเซตส์; ฮอนัน, AM; โทมัส สานัก; โกวด้า ม.; เขา เจซี ; และอื่น ๆ การวิเคราะห์ microbiota ในอุจจาระของผู้ป่วยโรคไต polycystic ตามการทำงานของไต: การศึกษานำร่อง ประสบการณ์ ไบโอล แพทย์ 2019, 244, 505–513.

49. พรีคัพ, ช.; วอดนาร์, ดี.-ซี. Gut Prevotella เป็น biomarker ที่เป็นไปได้ของอาหารและบทบาทของยูไบโอติกเทียบกับ dysbiotic: การทบทวนวรรณกรรมที่ครอบคลุม บร. เจ นัท 2019, 122, 131–140.

50. เดน เบสเทน, G.; van Eunen, เค; โกรน, อาก้า ; เวเนมา, เค; Reijngoud, ดีเจ; Bakker, BM บทบาทของกรดไขมันสายสั้นในการทำงานร่วมกันระหว่างอาหาร จุลินทรีย์ในลำไส้ และการเผาผลาญพลังงานของโฮสต์ J. ลิปิดเรส 2556, 54, 2325–2340.

51. เผิง, ล.; หลี่ ZR; กรีน, อาร์เอส; โฮลซ์มัน ไออาร์ ; Lin, J. Butyrate ช่วยเพิ่มสิ่งกีดขวางในลำไส้โดยอำนวยความสะดวกในการรวมตัวของจุดเชื่อมต่อที่แน่นหนาผ่านการกระตุ้นไคเนสโปรตีนที่เปิดใช้งาน AMP ในเซลล์ monolayers ของ Caco-2 เจ นัท 2552, 139, 1619–1625.

52. เคะคู, TO; ดูลาล เอส; เดโวซ์, อ.; Jovov, บี; Han, X. จุลินทรีย์ในทางเดินอาหารและมะเร็งลำไส้ใหญ่และทวารหนัก เช้า. เจ.ฟิสิออล. ตับ Physiol 2015, 308, G351–G363.

53. ลวดเย็บ ก.; Wong, C. ปัจจัยเสี่ยงต่อการลุกลามของโรคไตเรื้อรัง สกุลเงิน ความคิดเห็น กุมาร 2553, 22, 161–169.

54. ปีก MR; ราเมซานี, อ.; ปลา เอชเอส ; เดวานีย์ เจเอ็ม ; Raj, DS Epigenetics ของความก้าวหน้าของโรคไตเรื้อรัง: ความจริงหรือจินตนาการ? เซมิน. เนฟรอล 2556, 33, 363–374.

55. ซาบาติโน, อ.; Regolisti, G.; บรูซาสโก, I.; คาบาสซี, อ.; โมราบิโต เอส; Fiaccadori, E. การเปลี่ยนแปลงของสิ่งกีดขวางในลำไส้และจุลินทรีย์ในโรคไตเรื้อรัง เนฟรอล หมุน การปลูกถ่าย 2014, 30, 924–933.

56. มือ TW; Vujkovic-Cvijin, I.; ริดาอุระ, VK; Belkaid, Y. การเชื่อมโยงจุลินทรีย์ โรคเรื้อรัง และระบบภูมิคุ้มกัน แนวโน้มต่อมไร้ท่อ เมตาบ 2016, 27, 831–843.

57. รอสซี่ ม.; แคมป์เบล กัวลาลัมเปอร์ ; จอห์นสัน DW; สแตนตัน, ที; เวซีย์ ดา ; คูมเบส เจเอส ; เวสตัน แคนซัส ; ฮอว์ลีย์ ซม. ; แมควินนีย์ ก่อนคริสต์ศักราช; อันเกอร์เรอร์, JP; และอื่น ๆ สารพิษในปัสสาวะที่จับกับโปรตีน การอักเสบ และความเครียดจากปฏิกิริยาออกซิเดชัน: การศึกษาภาคตัดขวางในโรคไตเรื้อรังระยะที่ 3-4 โค้ง. เมด เรส 2557, 45, 309–317.

58. ดาริสิปูดี มินนิโซตา; Knauf, F. การอัปเดตเกี่ยวกับบทบาทของการอักเสบในการเกิดโรคของโรคไต กุมาร เนฟรอล 2558, 31, 535–544.

59. ตูริน, TC; โทเนลลี ม.; แมนส์ บีเจ ; อาเหม็ด เอสบี ; ราวานี ป.; เจมส์ ม.; Hemmelgarn, BR ความเสี่ยงตลอดชีวิตของ ESRD แยม. สังคม เนฟรอล 2012, 23, 1569–1578.

สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม:david.deng@wecistanche.com